上传文件参数名_上传基因组数据到NCBI

1、创建 BioProject 号和 BioSample 号

对某一个物种进行了基因组测序,则申请 BioProject 和 BioSample 号各一个。

2、使用 tbl2asn 准备后缀为 .sqn 的 ASN.1 文件

在 windows 下可以使用 Sequin 来制作 .sqn 文件。该文件是下面所述的 3 个文件的信息的综合体。tbl2asn 是命令行的工具,适合大基因组数据的 .sqn 文件生成。

3、生成包含作者信息的 .sbt 模板文件(Submission Template)

推荐使用网页http://www.ncbi.nlm.nih.gov/WebSub/template.cgi,填入数据生成 template.sbt 文件,并下载到本地。当然,此文件也可以使用 Sequin 生成。
填写信息时,可填入 BioProject 和 BioSample 号。

4、准备后缀为 .fsa 的fasta文件
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