vegan 包进行 Bioenv 分析

Bioenv 分析通过 计算样本群落结构的距离矩阵和 环境因子的距离矩阵，计算两个距离之间的相关系数，挑选出最佳的环境因子组合；

 

 

 

默认情况下，计算 群落结构的距离矩阵时， 使用 Bray-Curtis 距离； 计算环境因子的距离矩阵时，使用Euliodean 欧式距离， 计算相关性，则采用 spearman 相关系数；

示例用法：

> # The method is very slow for large number of possible subsets.
> # Therefore only 6 variables in this example.
> data(varespec)
> data(varechem)
> sol <- bioenv(wisconsin(varespec) ~ log(N) + P + K + Ca + pH + Al, varechem)
> sol

Call:
bioenv(formula = wisconsin(varespec) ~ log(N) + P + K + Ca +      pH + Al, data = varechem)