今天继续给大家介绍云平台宏基因组个性化分析中的物种与功能环境因子功能分析。
![ab3e7bd0a82bcad853359fb913075233.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/f4418bc6e141a79639f02073104b404d.png)
物种与功能环境因子功能分析
当有理化参数时,还可以基于物种/功能组成进行环境因子相关性分析、CCA/RDA、db-RNA、VPA、Mantel检验、偏Mantel检验等分析,找到与样品间的差异有关联的理化因子。
Mantel_Test分析
Mantel test是对两个矩阵相关关系的检验,可以根据所求的p值和r值直观的判断环境因子与微生物群落物种/功能分布的相关性。相对于CCA分析,Mantel test可以更加直观的根据所求r值和显著性水平p值来判断环境因子和微生物群落/功能分布的相关性。当p<0.05,则该环境因子跟微生物群落物种/功能分布间有显著相关性。
![51c97c306aebab9e25a4b6aefac29a58.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/a365fb36be872372f36b658c7b4b40fb.jpeg)
1、【环境因子表格】本部分分析需要在流程分析之前提供对应的环境因子表格才可以得到对应的分析结果。点击右侧【上传环境因子文件】,进入之后,下载环境因子表格的模板,请勿修改表格原本的格式,可添加更多的环境因子。
2、【环境因子矩阵】选择所需要的环境距离的矩阵
3、【控制矩阵】选择所需要的控