基因(gene)是能够编码蛋白质或者RNA等具有特定功能产物的/负载遗传信息的基本单位,即有遗传效应的DNA片段(可以理解为:Gene=protein+RNA[mRNA、tRNA、rRNA]);
基因组(genome):是指一个生物体内所有遗传物质的总和,对于含有线粒体或者叶绿体等结构的生物来说,还包括其中的环状DNA(线粒体:Mitochondrial DNA,Abbr:mDNA;叶绿体:chloropastDNA,Abbr:cpDNA);
对于真核和原核来说,其基因的结构是不同的。
真核生物基因组是以线性的染色体和线粒体和/或叶绿体的环状DNA组成,而原核则是由环状的拟核与质粒组成(以大肠杆菌为例)【原核这点以前是普遍认为的】,而且两者大小也不相同。但是,近年来由发现一些原核生物体含有多条环状染色体或线性染色体,或者两者皆有(Fig.2-2)。
此外,原核生物基因大多是连续的,没有多余的“无用基因”(这一点是相对真核而言)。而真核基因则是“断续”的,存在内含子(intron),因此称之“断裂基因(split gene)”或“割裂基因(interrupted gene)”,而且基因组中存在大量重复序列,根据重复频率不同,将这些重复序列分为:高度重复序列、中毒重复序列、单拷贝序列或低度重复序列等3种。
真核生物的基因含有多种复制、转录所需的元件:
如启动子:为转录提供转录起始信号(后面要提到的RNA pol结合位点),根据RNA pol的不同,又分为了三类启动子:
增强子:增强临近基因的转录;
沉默子:负调控元件;
绝缘子:阻碍增强子的作用。