miRTarBase 数据库简介

miRTarBase是一个收集并验证miRNA靶基因相互作用的数据库,包含23个物种的4076个miRNA与23054个基因的422147个靶基因相互作用记录。提供多种检索方式,如miRNA ID、靶基因、疾病和物种。特别强调人类miRNA的广泛调控作用,约80%的蛋白质编码基因受miRNA调控。数据可按证据可靠性筛选,并提供下载选项。
摘要由CSDN通过智能技术生成

miRTarBase 是一个手 收集的,经过实验验证过miRNA靶基因的数据库,对于每条miRNA靶基因的记录, 都会赋予1个唯一的 miRNA-target interactions (简称MTs) 编号,比如MIRT000012,目前miRTarBase 的版本为V7.0, 2017年9月15号更新,共收录了23个物种。4076 个miRNA, 23054 个基因,422147 个靶基因相互作用。

网址:

    http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/php/index.php

miRTarBase 提供了多种检索方式:

1) miRNA ID

2)   Target Gene

3)   Disease

4)  Species

对于 Species, 分成了以下几类:

1)Mammalia :  哺乳动物

  Homo sapiens :人

       Mus musculus : 小鼠

      Rattus norvegicus : 大鼠

      Sus scrofa  : 猪

      Ovis aries  : 羊

      Cricetulus griseus 

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