miRTarBase 是一个手 收集的,经过实验验证过miRNA靶基因的数据库,对于每条miRNA靶基因的记录, 都会赋予1个唯一的 miRNA-target interactions (简称MTs) 编号,比如MIRT000012,目前miRTarBase 的版本为V7.0, 2017年9月15号更新,共收录了23个物种。4076 个miRNA, 23054 个基因,422147 个靶基因相互作用。
网址:
http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/php/index.php
miRTarBase 提供了多种检索方式:
1) miRNA ID
2) Target Gene
3) Disease
4) Species
对于 Species, 分成了以下几类:
1)Mammalia : 哺乳动物
Homo sapiens :人
Mus musculus : 小鼠
Rattus norvegicus : 大鼠
Sus scrofa : 猪
Ovis aries : 羊
Cricetulus griseus