多类别分类和多标签分类的定义
给定一组训练实例(X1 ,Y1 )，(X2 ,Y2 )，......(Xn ,Yn )，典型地，每个实例Xi i=1,2,...,n是一个m维向量，Yi 是一个有l(l>=1)个类别的向量，分类的任务是从训练实例中学习一个模型f:X->Y，从而对新的实例给出一个值得信赖的类别预测。
多类分类(multiclass classification)学习的分类器旨在对一个新的实例指定唯一的分类类别，常用的策略有两类：基于后验概率或距离一次给出所有类别的度量，选择度量值最大的类别作为预测类别；将多类分类分解为许多二元分类问题，然后组合所有二元分类的结果。
多标签分类(multilabel classification)分类器给一个新的实例指定多个类别。这个分类模型有很广泛的实际应用，如：一个文档可能同时属于多个分类；一个蛋白质可能具有多个功能。并且，多个标签之间可能存在一定的依赖或约束关系，如蛋白质的所有功能组成的Go(gene ontology)。这个依赖或约束关系具有层次特性，经常可以描述为树或有向无环图结构，机器学习社团称之为层次多标签分类。由于模型的输出具有层次结构，因此层次多标签分类又属于另外一个近来非常活跃的研究领域：结构预测。层次多标签分类和结构预测都是崭新的、富有挑战性的研究领域。
使用scikit-learn实现多类别及多标签分类算法
多标签分类格式
对于多标签分类问题而言，一个样本可能同时属于多个类别。如一个新闻属于多个话题。这种情况下，因变量yy需要使用一个矩阵表达出来。
而多类别分类指的是y的可能取值大于2，但是y所属类别是唯一的。它与多标签分类问题是有严格区别的。所有的scikit-learn分类器都是默认支持多类别分类的。但是，当你需要自己修改算法的时候，也是可以使用scikit-learn实现多类别分类的前期数据准备的。
多类别或多标签分类问题，有两种构建分类器的策略：One-vs-All及One-vs-One。下面，通过一些例子进行演示如何实现这两类策略。
#
from sklearn.preprocessing import MultiLabelBinarizer
y = [[2,3,4],[2],[0,1,3],[0,1,2,3,4],[0,1,2]]
MultiLabelBinarizer().fit_transform(y)
array([[0, 0, 1, 1, 1],
[0, 0, 1, 0, 0],
[1, 1, 0, 1, 0],
[1, 1, 1, 1, 1],
[1, 1, 1, 0, 0]])
One-Vs-The-Rest策略
这个策略同时也称为One-vs-all策略，即通过构造K个判别式（K为类别的个数），第ii个判别式将样本归为第ii个类别或非第ii个类别。这种分类方法虽然比较耗时间，但是能够通过每个类别对应的判别式获得关于该类别的直观理解（如文本分类中每个话题可以通过只属于该类别的高频特征词区分）。
多类别分类学习
from sklearn import datasets
from sklearn.multiclass import OneVsRestClassifier
from sklearn.svm import LinearSVC
iris = datasets.load_iris()
X,y = iris.data,iris.target
OneVsRestClassifier(LinearSVC(random_state = 0)).fit(X,y).predict(X)
array([0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1,
1, 2, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 2, 2, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1,
1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2,
2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 1, 2, 2, 2, 1, 2, 2, 2, 2,
2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2])
多标签分类学习
Kaggle上有一个关于多标签分类问题的竞赛：Multi-label classification of printed media articles to topics。
关于该竞赛的介绍如下：
This is a multi-label classification competition for articles coming from Greek printed media. Raw data comes from the scanning of print media, article segmentation, and optical character segmentation, and therefore is quite noisy. Each article is examined by a human annotator and categorized to one or more of the topics being monitored. Topics range from specific persons, products, and companies that can be easily categorized based on keywords, to more general semantic concepts, such as environment or economy. Building multi-label classifiers for the automated annotation of articles into topics can support the work of human annotators by suggesting a list of all topics by order of relevance, or even automate the annotation process for media and/or categories that are easier to predict. This saves valuable time and allows a media monitoring company to expand the portfolio of media being monitored.
我们从该网站下载相应的数据，作为多标签分类的案例学习。
数据描述
这个文本数据集已经用词袋模型进行形式化表示，共201561个特征词，每个文本对应一个或多个标签，共203个分类标签。该网站提供了两种数据格式：ARFF和LIBSVM,ARFF格式的数据主要适用于weka，而LIBSVM格式适用于matlab中的LIBSVM模块。这里，我们采用LIBSVM格式的数据。
数据的每一行以逗号分隔的整数序列开头，代表类别标签。紧接着是以\t分隔的id:value对。其中，id为特征词的ID，value为特征词在该文档中的TF-IDF值。
形式如下。
58,152 833:0.032582 1123:0.003157 1629:0.038548 ...
数据载入
# load modules
import os
import sys
import numpy as np
from sklearn.datasets import load_svmlight_file
from sklearn.preprocessing import LabelBinarizer
from sklearn.preprocessing import MultiLabelBinarizer
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
from sklearn.multiclass import OneVsRestClassifier
from sklearn import metrics
# set working directory
os.chdir("D:\\my_python_workfile\\Thesis\\kaggle_multilabel_classification")
# read files
X_train,y_train = load_svmlight_file("./data/wise2014-train.libsvm",dtype=np.float64,multilabel=True)
X_test,y_test = load_svmlight_file("./data/wise2014-test.libsvm",dtype = np.float64,multilabel=True)
模型拟合及预测
# transform y into a matrix
mb = MultiLabelBinarizer()
y_train = mb.fit_transform(y_train)
# fit the model and predict
clf = OneVsRestClassifier(LogisticRegression(),n_jobs=-1)
clf.fit(X_train,y_train)
pred_y = clf.predict(X_test)
模型评估
由于没有关于测试集的真实标签，这里看看训练集的预测情况。
# training set result
y_predicted = clf.predict(X_train)
#report
#print(metrics.classification_report(y_train,y_predicted))
import numpy as np
np.mean(y_predicted == y_train)
0.99604661023482433
保存结果
# write the output
out_file = open("pred.csv","w")
out_file.write("ArticleId,Labels\n")
id = 64858
for i in xrange(pred_y.shape[0]):
label = list(mb.classes_[np.where(pred_y[i,:]==1)[0]].astype("int"))
label = " ".join(map(str,label))
if label == "": # if the label is empty
label = "103"
out_file.write(str(id+i)+","+label+"\n")
out_file.close()
One-Vs-One策略
One-Vs-One策略即是两两类别之间建立一个判别式，这样，总共需要K(K−1)/2K(K−1)/2个判别式，最后通过投票的方式确定样本所属类别。
多类别分类学习
from sklearn import datasets
from sklearn.multiclass import OneVsOneClassifier
from sklearn.svm import LinearSVC
iris = datasets.load_iris()
X,y = iris.data,iris.target
OneVsOneClassifier(LinearSVC(random_state = 0)).fit(X,y).predict(X)
array([0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1,
1, 2, 1, 2, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 2, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1,
1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2,
2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2,
2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2])
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