GHMM安装教程

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#环境: 
#ubuntu 12.04 LTS 32bit
#GHMM-0.9-rc1
#Python 2.7.3
#IPython 0.12.1

#先安装编译环境
sudo apt-get install build-essential
#安装make工具
sudo apt-get install automake
#安装libtool 不确定是否必需，因为我先安装libtool
sudo apt-get install libtool

#下面正式开始 要sudo不然权限不够
sudo ./autogen.sh
#安装依赖 libxml-2.6.0 这里安装libxml2-dev 
#但我多安装了libxml++2.6-2 这个c++版本应是非必需的
sudo apt-get install libxml2-dev
#configure
sudo ./configure
#安装swig 若不打算用Python wrappe, 不用装
sudo apt-get install swig
#编译 
sudo make
#安装完成

测试下：

ipython
import ghmm 

显示

ImportError : libghmm.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory

解决方法：

cd ~
vi .bashrc
#在文件最后添加
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/lib

或者参考：
http://stackoverflow.com/questions/9216059/import-error-ghmm-library

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