mage J和Graphpad如何对Western Blot条带灰度分析

原文 mage J和Graphpad如何对Western Blot条带灰度分析

WB是研究蛋白表达的一个经典方法。对于一些时间点或者是不同组织蛋白表达量的分析就涉及到量的变化。一些凝胶成像软件带有此分析工具,比如Quantity One,Bandscan,Gel-Pro Analyzer等成像系统专用软件。除了这些软件,还有一个比较简单的综合性质图像处理软件Image J可以很方便的进行灰度分析。而且Image J是开源性质的免费软件,可以在其官网直接下载使用。

对Western Blot条带进行数值化有两种方法——灰度分析光密度分析。灰度是计算机图像分析仪根据图像颜色深浅分为256个级别。灰度值越小物体颜色越深。光密度是指光线通过溶液或某一物质前的入射光强度IO与该光线通过溶液或物质后的透射光强度Ib比值的对数OD=log(IO/Ib);图像分析中,入射光和透射光强度分别被切片上最亮区域的平均灰度值和待测目标平均灰度值取代,则图像分析系统的光密度值=log(切片标本最亮区域的平均灰度值(g0)/待测目标的平均灰度值(g))。光密度值越大,物体颜色越深,阳性物质相对含量越大。

对于灰度值来说,切片标本制作时染色时间长短,以及测量时显微镜照明光源电压的大小对其影响很大。而光密度是一个比值。是通过计算一张切片标本最亮区域的平均灰度值与该切片标本中待测目标的平均灰度值的比值,再根据数学公式计算而来的,所以受切片标本染色时间长短及照明光源电压关系很小。

然而有研究实践显示,灰度值与光密度值二者之间存在着线性关系,都可以用来进行WB定量分析。

    同样,Image J软件进行WB条带定量分析时也存在两种方法,此处只列举一种方法,具体步骤如下。

1、下载安装,并打开Image J软件。

2、导入WB条带图片。File→Open→ 弹出对话框→选择文件夹→找到WB条带。

3、把图片转化成灰度图片:Image→Type→8-bit。这时WB图片将会随之改变。

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