多位点序列分型_Pubmlst： 一个用于细菌分型的热门网站

点击上面“蓝字”关注我们 多位点序列分型(Multilocus sequence typing, MLST)[1]是近年来针对细菌分型发展很快的一种分子生物学分析方法，具有很高的分辨力，既适用于分子流行病学研究，也可用于分子进化学的研究。该方法被广泛应用于病原菌、环境菌和真核生物中。

        MLST主要是基于测定核苷酸序列的一种细菌分型方法，通过PCR扩增6~10个管家基因内部400~600bp的核苷酸序列，每个位点的序列根据其发现的时间顺序赋予一个等位基因编号，每一株菌的等位基因编号按照指定的顺序排列就是它的等位基因谱，也即是这株菌的序列型(sequence type, ST)，每个ST均代表一组单独的核苷酸序列信息。通过比较ST可以发现菌株的相关性,即密切相关菌株具有相同的ST或仅有极个别基因位点不同的ST，而不相关菌株的ST至少有3个或3个以上基因位点不同。