python与go数据分析_【数据处理】python将GO注释结果整理为WEGO文件

通常，比对NR库后为m8格式，通过NR和GO数据库对应关系文件，写代码整理为Gene——>GO文件，如下：

image.png

这里是一对一的关系，要转换为WEGO格式文件，即一对多关系，如下：

image.png

用python脚本处理代码示例如下：

#! /usr/bin/env python

import optargs

import os

import sys

usage='''

tidy go annotation file to wego file

'''

option = optparse.OptionParser(usage)

option.add_option('','--infile',help='* annot file',default='')

option.add_option('','--outfile',help='* outfile',default='')

(opts,args) = option.parse_args()

infil