matlab 聚类分析 画出聚类树,plot单独画出pheatmap返回的聚类结果（聚类树）

前面两篇文章介绍到pheatmap返回行和列的hclust结果：

1、按照前两篇文章的基础数据获得的热图结果，对行(基因的聚类结果)聚类树单独进行绘制，可以借助plot()函数：

默认画法

> plot(list$tree_row)

而有一个有趣的函数rect.hclust()可以将hclust结果绘图，并圈选出不同的cluster，譬如设定3个cluser:

> rect.hclust(list$tree_row,k=3)

得到如下结果：

2、而将hclust结果转换成另类树形图as.dendrogram()可以选择type画出其他形状的树形图：

这个树形图一共包含两个type，可以查询?as.dendrogram() 或者?plot.dendrogram得知

> plot(as.dendrogram(list$tree_row),type = "triangle")