R语言画好看的聚类树

本文介绍了如何使用R语言结合特定R包绘制出美观且交互式的聚类树。通过加载数据,进行聚类分析,然后利用包的特性进行图形美化,包括调整树枝长度、叶子大小,并将数据列值映射到图形颜色和大小上,最终得到具有视觉吸引力的大型聚类树。
摘要由CSDN通过智能技术生成

本次例子用到的R包主要有TreeAndLeafRedeRigraphRColorBrewer,示例数据来自于Rflexclust包的nutrient数据。

加载数据和R包

library(TreeAndLeaf)
library(RedeR)
library(igraph)
library(RColorBrewer)

data(nutrient, package = "flexclust") # 加载数据

对数据进行简单的查看和处理

head(nutrient) # 简单看一下数据

                energy protein fat calcium iron
beef braised       340      20  28       9  2.6
hamburger          245      21  17       9  2.7
beef roast         420      15  39       7  2.0
beef steak         375      19  32       9  2.6
beef canned        180      22  10      17  3.7
chicken broiled    115      20   3       8  1.4

row.names(nutrient) <- tolow
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