r语言Isfit_R语言-Survival analysis(生存分析)

这篇博客介绍了生存分析在临床癌症研究中的应用,包括Kaplan-Meier生存曲线、Log-rank检验和Cox比例风险模型。通过R语言的survival和survminer包,展示了如何进行生存率估计和生存曲线绘制,并通过实例解释了生存分析的基本术语和方法。
摘要由CSDN通过智能技术生成

整理下最近看的生存分析的资料

生存分析是研究生存时间的分布规律,以及生存时间和相关因素之间关系的一种统计分析方法

其主要应用领域:

Cancer studies for patients survival time analyses(临床癌症上病人生存分析)

Sociology for "event-history analysis"(我也不懂)

engineering for "failure-time analysis"(类似于机器使用寿命,故障等研究) 在癌症研究中,其典型研究问题则有:

What is the impact of certain clinical characteristics on patient’s survival(某些临床特征对病人的影响有哪些)

What is the probability that an individual survives 3 years?(病人个体三年存活率有多少)

Are there differences in survival between groups of patients?(两组病人之间的生存率有什么差异)

生存分析使用的方法:

Kaplan-Meier plots to visualize survival curves(根据生存时间分布,估计生存率以及中位生存时间,以生存曲线方式展示,从而分析生存特征,一般用Kaplan-Meier法,还有寿命法)

Log-rank test to compare the survival curves of two or more groups(通过比较两组或者多组之间的的生存曲线,一般是生存率及其标准误,从而研究之间的差异,一般用log rank检验)

Cox proportional hazards regression to describe the effect of variables on survival(用Cox风险比例模型来分析变量对生存的影响,可以两个及两个以上的因素,很常用)

所以一般做生存分析,可以用KM(Kaplan-Meier)方法估计生存率,做生存曲线,然后可以根据分组检验一下多组间生存曲线是否有显著的差异,最后用Cox风险比例模型来研究下某个因素对生存的影响

基本术语:

Event(事件):在癌症研究中,事件可以是Relapse,Progression以及Death

Survival time(生存时间):一般指某个事件的开始到终止这段事件,如癌症研究中的疾病确诊到缓解或者死亡,其中有几个比较重要的肿瘤临床试验终点:

OS(overall survival):指从开始到任意原因死亡的时间,我们一般见到的5年生存率、10年生存率都是基于OS的

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