有一天,科学家们从你身上取走几个细胞,通过对细胞的DNA进行分析和读取信息,就可以知道你的身体在什么时间,发生了什么。
细胞像一台电脑一样,或者称之为“史学家”更妥当,详细的记录着周围发生的一切
你可能不敢相信,不过,这不是“神话”,而是正在发生的事实。
这种技术,我们称之为DNA信息存储技术,也是合成生物学的一个组成部分。
一个细胞就是一台生物“电脑”
细胞是构成生命的基本单位,大家肯定都不陌生。
但是谈到细胞核里的遗传物质——DNA,也许就会略显高深了。
DNA全称是脱氧核糖核酸,包含A,T,C,G四个碱基,不同的碱基一定排列顺序的DNA组成了功能单位基因。
目前,随着科学和技术的不断进步,生命科学领域也迎来了蓬勃发展的春天。
基因工程技术已经可以对碱基进行有目的编辑,以便在细菌和哺乳动物细胞的DNA中进行信息存储和处理。
科学家们采用基因编辑技术将大肠杆菌和人类细胞工程化,使得它们可以记录多个分子事件以及时间和顺序在它们发生。
怎么才能做到呢?
首先我们将细胞转化为分子记录器,我们采用基因编辑技术,对DNA进行“编程”,打上一个永久性“烙印”,让它可以世代相传,永不消失。而这个植入的“程序”可以记录细胞周围发生的事情。
活细胞DNA“电脑”有什么用呢?
它的用途大着呢,比如:
1. 我们可以利用它来改进土壤或水中的细菌细胞,从而用于检测和记录环境毒素、杀虫剂、微量元素等物质是否存在,或者含量几何。
2. 对于哺乳动物这种复杂生物来说,细胞DNA“电脑”可用于追踪疾病发生、发展过程中发生的一切,从而有利于人们认识疾病的原因,从而达到精准医疗。
3. 在法医领域,如果每个人都可以植入一定的活细胞“电脑”,一旦发生命案就可以了解死亡时间、原因等,有利于案件侦破。
以前,科学家们研究的DNA分子记录技术使用CRISPR酶或重组酶来插入、翻转、替换或改变特定的碱基或DNA片段。这种方法往往错误率高,特异性差,难以满足信息记录要求。
现在,人们开发了一种称为碱基特异性编辑的CRISPR技术来进行单碱基对编辑。这样可以识别更小和更精确的突变,意味着信息存储的能力更强,并且编辑本身可以作为更多下游功能的指令“读取”。
什么原理呢?
说了这么多,您可能会问,这个技术究竟是什么原理呢?
简单的说,这种新方法采用两种类型的基因序列:
一种编码类似“导航”的特异性指导RNA,用于有目的的编辑DNA分子;
一种是类似“剪刀”CRISPR-Cas9酶(与gRNA结合的酶)融合的碱基编辑酶;
将这两个工具转染到细胞中,当这些细胞周围发生异常情况时,表达gRNA序列,RNA与Cas9碱基编辑融合蛋白结合,然后将其转运至靶DNA序列(与gRNA匹配) )进行编辑。
随后可以通过DNA测序分析或记录编辑结果。
是不是很神奇?
生命科学还有很多黑科技,随后我们逐一详细介绍,刷新一下您的世界观。
参考文献:
1. F. Farzadfard et al., “Single-nucleotide-resolution computing and memory in living cells,” Molecular Cell, 75: P769-780.E4, 2019.