主成分分析碎石图_R语言__对环境因子数据进行主成分分析（PCA）分析

  简介  

  主成分分析((Principal Component Analysis，PCA))：基于PCA特征向量的线性无约束排序方法。

实验中采集的定量环境变量，它们有什么相关性？各样方的环境特征是否存在相似性？借着以上问题，本文通过R语言prcomp函数对环境因子进行主成分分析，制作排序图以分析各环境因子之间存在的正、反相关关系；制作散点图以直观查看各样方环境因子间存在的时间和空间差异情况。

 分析 

#指定工作目录

setwd("C:/Rtemp/SJK2017ENV_PCA/")  

#载入数据， 标题存在(第一列)

df

header= T,row.names = 1)

#展示前六行数据，即在制作的CSV数据格式展示

head(df)

#展示全部数据

df

#进行主成分分析

df1

#分析结果

summary(df1)

#结果分析：

#df