MIMIC数据库安装保姆级教程（下)

mimic数据库使用介绍：

MIMIC-IV，重症医学数据库介绍和使用说明

MIMIC数据库下载权限申请保姆级教程（上）

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MIMIC数据库安装保姆级教程（上）

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MIMIC数据库，常用查询指令SQL基础(一)

安装前准备

执行安装前需要准备以下文件：

1，mimic数据导入脚本。

2，mimiciv数据文件。

mimic数据导入脚本可以在官方的github网址上下载，网址为：https://github.com/MIT-LCP/mimic-code/tree/main。

访问github网站需要科学上网，如果同学们不能访问，小编也已经把脚本准备好了，关注公众号“科研收录”，后台回复“mimic安装脚本”就可以获取下载地址。

mimiciv数据文件需要在官网申请权限才可以下载使用，不知道怎么申请的同学，可以参考小编以前的文章：

MIMIC数据库下载权限申请保姆级教程（上）

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安装脚本介绍

原本官方的安装脚本一共有8个，但是我们一般只会使用其中的4个脚本就可以，为了简化学习，小编只列出了需要安装的这4个脚本：

以上4个脚本一定要按照顺序执行！！！

01

创建数据库

打开psql

在psql中执行以下代码创建mimiciv数据库

#创建mimic数据库
DROP DATABASE IF EXISTS mimiciv;
CREATE DATABASE mimiciv OWNER postgres;

02

创建表

执行以下语句创建表，注意：windows系统下脚本目录请使用正斜杠

#切换到mimiciv数据库
\c mimiciv
#生成表，create.sql是生成表的目录，注意使用正斜杠
\i D:/workspace/mimic-code-main/mimic-iv/buildmimic/postgres/create.sql

03

导入数据

执行以下语语句，通过7z加载mimiciv数据，其中mimic_data_dir为mimiciv数据存放路径

# 设置mimic数据存放路径
\set mimic_data_dir 'D:/mimic/mimiciv-data/mimic-iv-2.2'
# 加载数据
\i D:/workspace/mimic-code-main/mimic-iv/buildmimic/postgres/load_7z.sq

数据导入过程会比较漫长，一般需求几个小时才能完成，而且导入的过程中可能会出现假死的情况，需要每隔一小段时间按下Enter键以便继续导入。数据的导入完成后，可以在navicat上查看导入的数据。

04

创建主键

执行以下语句，创建表的主键

# 创建主键
\i D:/workspace/mimic-code-main/mimic-iv/buildmimic/postgres/constraint.sql

主键创建完毕后，可以在navicat中校验主键是否创建成功，在navicat中选中表，右键点击“设计表”，如果看到一个类似于钥匙的图标，则表示主键创建成功了。

05

创建索引

执行以下脚本创建索引

# 增加索引
\i D:/workspace/mimic-code-main/mimic-iv/buildmimic/postgres/index.sql

创建索引的过程也会比较长，可能会持续一个多小时，创建完毕后，可以在navicat中检查索引是否创建成功。选中表之后，右键点击“设计表”，然后点击“索引”选项卡，如果索引选项卡下有数据，则说明索引已经创建成功。

至此，mimiciv数据就成功导入到postgres了，如果需要安装脚本请关注公众号“科研收录”，后台回复“mimic安装脚本”即可。如果同学们在数据库安装过程中遇到任何困难，也可后台私聊小编。