计算机辅助药物筛选教程,药物筛选之计算机辅助药物设计

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计算机辅助药物设计(computer-aided drug design，CADD)是近年来发展起来的研究与开发新药的一种崭新技术，它大大加快了新药设计的速度，节省了创制新药工作的的人力和物力，使药物学家能够以理论为指导，有目的地开发新药。CADD是一个相当大的论题，涉及到结构化学、药物化学、分子药理学、生物化学、结构生物学、分子生物学、化学生物学、细胞生物学、生理学、病理学、生物物理学、组合化学、量子化学、分子力学、分子动力学、分子图形学、计算化学、化学信息学、生物信息学、X射线晶体学、核磁共振技术、计算机图形技术、数据库技术和人工智能技术等基础学科和应用学科与技术。融合这些学科知识与技术，CADD在药物作用和药理活性预测、药效基团研究、药物构效分析、全新药物设计、高通量虚拟筛选及合成数据库设计等方面展示了强大的威力，大大地提高了药物设计水平，并趋向于定向化和合理化，开辟了广阔的前景，合研生物在该领域拥有丰富的经验帮助客户进行计算机辅助药物设计。

通常意义上的CADD仅指基于分子模拟(计算化学)的分子设计技术，又可分为基于受体结构的药物设计(receptor-basedor structure-based drug design， SBDD)和基于配体的药物设计(ligand-based drug design， LBDD)。SBDD从受体的结构和性质出发寻找可以与其特异结合的配体分子，所以也称为直接药物设计，包括基于受体结构的分子对接、活性位点分析、从头药物设计(生长或连接算法)等具体方法；LBDD根据已知活性的先导分子，构建结构-活性关系或药效基团模型，称为间接药物设计，包括定量构效关系(QSAR)、药效基团模型、受体映射、基于分子形状的叠合等具