计算机模拟虚拟筛选操作流程

计算机模拟虚拟筛选操作流程：

1、寻找同一靶点的不同小分子活性药物；

2、对得到的小分子药物进行聚类分析；

3、对分类得到的同一类小分子药物进行药效团的创建；

4、对不同类的药效团进行share（可选）；

5、对创建的药效团进行验证；

5.1 利用active化合物在DUDe中生成decoys化合物；

5.2 用active化合物和decoys化合物对创建的药效团进行ROC曲线的绘制，ROC曲线越靠近左上角，说明创建的药效团越好，一般大于0.5，可考虑用来进行下一步的大规模虚拟筛选；

6、对虚拟筛选得到的结果再进行对接；

7、分析对接结果与药效团的匹配程度；

8、分析对接结果与原配体的静电场相似性；

9、取一截断值，挑选化合物进行生物活性测试或进一步的优化；

单从打分来看，最高打分的分子有活性只有20%-40%是正确的，还要根据ΔG（gibbs自由能）（ΔG=ΔH-T*ΔS）