median函数的作用:求给定数值的中位数
median(M,1) 表示按每列返回一个值,为该列从大到小排列的中间值。
medain(M,2) 表示按每行返回一个值,为该行从大到小排列的中间值。
mean函数的作用:返回沿数组中不同维元素的平均值
mean(M,1) 表示返回该矩阵各列向量的均值
mean(M,2) 表示返回该矩阵各行向量的均值
matlab中fopen函数可以将指定文件打开
fid=fopen(filename,permission);
filename 是文件的路径和文件名字。
fid=+N(N是正整数),表示文件打开成功,文件代号是N
fid=-1,表示文件打开不成功
fid在此次文件关闭前总是有效的
permission是文件打开方式的参数
r 读出
w 写入(文件若不存在,自动创建)、覆盖重新写入
a 后续写入(文件若不存在,自动创建)
r+ 读出与写入(文件应该已存在)
w+ 重新刷新写入(文件若不存在,自动创建)
a+ 后续写入(文件若不存在,自动创建)
matlab中fprintf函数可以将数据按指定格式写入到文本文件中
数据的格式化输出: fprintf(fid,format,variables);
fid为文件句柄,指定要写入数据的文件
format用来控制数据输出时采用的格式
%d 整数
%e 实数------>科学计数法形式
%f 实数------>小数形式
%s 输出字符串
tic
clear all
load cnvtcgaGBM.mat
fid=fopen('cnvtcgaGBMt.txt','w');
matrix=C;
[m,n]=size(matrix);
for i=1:1:m
for j=1:1:n
if j==n
fprintf(fid,'%f\n',matrix(i,j));
else
fprintf(fid,'%f\t',matrix(i,j));
end
end
end
fclose(fid);
toc
读入写出
clc;clear all;
fid=fopen('/Users/student/Desktop/escaad_t_c_yResult.txt','wt');
ex=importdata('escaad_t_c_y.txt');
gene = repmat('escaad',24702,1);
for ii=1:24702
[row,clo]=find(ex(:,1)==ii);
count=size(row,1);
data=[];
for i=1:count
data(i,1)=ex(row(i,1),2);
end
fprintf(fid,'%d\t%s\t%f\t%f\n',ii,gene(ii,:),median(data,1),mean(data,1));
end
fclose(fid);
cell矩阵的写出
tic
clear all
load cnvtcgaLUSC.mat
fid=fopen('result.txt','w');
matrix=pIDn';
[m,n]=size(matrix);
for i=1:1:m
for j=1:1:n
if j==n
fprintf(fid,'%s\n',matrix{i,j});
else
fprintf(fid,'%s\t',matrix{i,j});
end
end
end
fclose(fid);
toc
matlab写出到csv文件
a=magic(5)
csvwrite('demo.csv',a)