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原创 安装ACPYPE

撰文时间2018年6月11日最近在做一个李继存老师写的示例使用AmberTools+ACPYPE+Gaussian创建小分子GAFF力场的拓扑文件里面需要用到Ambertool,Gaussian,ACPYPE,第一个Ambertool为开源软件,有详细的安装说明。第二个是Gaussian为商业软件,有详细的破解说明,偏偏第三个较为小众,费了一番周折。在李继存老师撰写上面的文章的时候ACPYPE的g...

2018-06-11 22:28:43 4641 2

原创 树莓派官方32bit系统和Pi64系统性能测试

0.前言Raspbian是树莓派的官方系统,运行稳定,软件齐全,用户广泛,支持也非常好。但是官方为了保持一致性和连贯性,没有为新的设备(树莓派3使用四核A53CPU)开发新的系统版本,而是所有的树莓派硬件设备运行同样的系统镜像,这给初学者带来极大的方便,不过对于geek来说,这显然是不够的,因为它没有发挥处理器的全部性能。官网截图:Raspbian是所有树莓派版本的官方系统。本次测试使用的64为系...

2018-04-11 20:03:06 14634

原创 树莓派(Debian/Ubuntu)编译安装gromacs2016.5

1.前言时常看到大家在追求更高的计算能力,计划着去买新的计算机,这里算是娱乐吧,尝试一下在树莓派上安装gromacs2016.5。同时本文也适用与64位的Debian/Ubuntu系统下gromacs的编译安装在树莓派这样的四核arm A53 的硬件上安装显然不会有什么性能,但是可以测试一下集群的配置,不过目前为止我只有一部树莓派,终极目标是搭建一个三个节点的集群,目前还不确定是买三个树莓派还是三...

2018-04-11 17:33:09 1205

原创 win安装qutip

http://qutip.org/docs/latest/installation.html#installation-on-ms-windows官网安装说明翻译:我们建议并支持将QuTiP安装到Conda环境中。python包管理软件(如Python-(x,y))也可能可以工作,但不受支持。 从QuTiP 4.1开始,Windows上安装推荐需使用Python 3.5+以及Visual Stud...

2018-04-09 10:27:46 3284 2

空空如也

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