Cora数据集介绍+python读取

最新推荐文章于 2024-07-02 09:24:33 发布
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分类专栏： 图深度学习
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本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_39373480/article/details/88742200
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本文介绍了Cora数据集，它由机器学习论文组成，共2708篇，分为七类。数据集包含Content和Cites两个文件，前者记录论文描述，后者记录引用关系。文中给出了下载地址https://linqs.soe.ucsc.edu/data ，还提及了用Python读取该数据集的方法。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

Cora数据集介绍+读取


在这里插入图片描述

1. 数据集概括

Cora数据集由机器学习论文组成，是近年来图深度学习很喜欢使用的数据集。在数据集中，论文分为以下七类之一:

  • 基于案例
  • 遗传算法
  • 神经网络
  • 概率方法
  • 强化学习
  • 规则学习
  • 理论

论文的选择方式是，在最终语料库中，每篇论文引用或被至少一篇其他论文引用。整个语料库中有2708篇论文。

在词干堵塞和去除词尾后，只剩下1433个独特的单词。文档频率小于10的所有单词都被删除。

2. 数据集组成

目录包含两个文件:

2.1 Content文件

.content文件包含以下格式的论文描述:

<paper_id> <word_attributes>+ <class_label>

每行的第一个条目包含纸张的唯一字符串标识，后跟二进制值，指示词汇中的每个单词在文章中是存在(由1表示)还是不存在(由0表示)。

最后，该行的最后一个条目包含纸张的类别标签。因此数据集的feature应该为 2709 × 1433 2709 \times 1433 2709×1433维度。第一行为 i d x idx idx，最后一行为 l a b e l label label。

部分数据

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13195	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	0	0	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	Reinforcement_Learning
......

2.2 Cites文件

那个.cites文件包含语料库的引用’图’。每行以以下格式描述一个链接:

<被引论文编号> <引论文编号>

每行包含两个纸质id。第一个条目是被引用论文的标识，第二个标识代表包含引用的论文。链接的方向是从右向左。

如果一行由“论文1 论文2”表示，则链接是“论文2 - >论文1”。可以通过论文之间的索引关系建立邻接矩阵adj

部分数据

35	1033
35	103482
35	103515
35	1050679
35	1103960
35	1103985
35	1109199
35	1112911
......

3. 下载地址

https://linqs.soe.ucsc.edu/data

4. 如何读取（python）

def load_data(path="./data/cora/", dataset="cora"):
    """Load citation network dataset (cora only for now)"""
    print('Loading {} dataset...'.format(dataset))

    idx_features_labels = np.genfromtxt("{}{}.content".format(path, dataset), dtype=np.dtype(str))
    features = sp.csr_matrix(idx_features_labels[:, 1:-1], dtype=np.float32)
    labels = encode_onehot(idx_features_labels[:, -1])

    # build graph
    idx = np.array(idx_features_labels[:, 0], dtype=np.int32)
    idx_map = {j: i for i, j in enumerate(idx)}
    edges_unordered = np.genfromtxt("{}{}.cites".format(path, dataset), dtype=np.int32)
    edges = np.array(list(map(idx_map.get, edges_unordered.flatten())), dtype=np.int32).reshape(edges_unordered.shape)
    adj = sp.coo_matrix((np.ones(edges.shape[0]), (edges[:, 0], edges[:, 1])), shape=(labels.shape[0], labels.shape[0]), dtype=np.float32)

    # build symmetric adjacency matrix
    adj = adj + adj.T.multiply(adj.T > adj) - adj.multiply(adj.T > adj)

    features = normalize_features(features)
    adj = normalize_adj(adj + sp.eye(adj.shape[0]))

    idx_train = range(140)
    idx_val = range(200, 500)
    idx_test = range(500, 1500)

    adj = torch.FloatTensor(np.array(adj.todense()))
    features = torch.FloatTensor(np.array(features.todense()))
    labels = torch.LongTensor(np.where(labels)[1])

    idx_train = torch.LongTensor(idx_train)
    idx_val = torch.LongTensor(idx_val)
    idx_test = torch.LongTensor(idx_test)

    return adj, features, labels, idx_train, idx_val, idx_test
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样本特征，标签，邻接矩阵该数据集共2708个样本点，每个样本点都是一篇科学论文，所有样本点被分为8个类别，类别分别是1）基于案例；2）遗传算法；3）神经网络；4）概率方法；5）强化学习；6）规则学习；7）理论
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03-11 1334
在使用Cora数据集时，通常需要进行一些预处理工作，例如文本的标记化（Tokenization）、词袋模型的构建、图网络的表示等。研究者可以选择将文本信息和引用网络结合起来，以便在模型训练中充分利用这两方面的信息。研究者可以利用该数据集开发算法，探索如何更好地利用文本信息和引用网络结构来进行论文分类。Cora数据集包含了一个文献网络，其中节点表示论文，边表示引用关系。Cora数据集是一个用于文献学术论文分类的常用数据集，主要用于机器学习和自然语言处理研究。边表示论文之间的引用关系，构成了一个引用网络。
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进一步处理和分析接下来，你可以使用加载和解析的数据进行进一步的处理和分析，例如构建图结构、训练机器学习模型或进行数据可视化等操作。如果你打算使用 PyTorch Geometric，可以根据需要将数据转换为 PyTorch 张量或直接使用 PyTorch Geometric 提供的工具类加载数据。通过这些步骤，你可以有效地加载和处理手动下载的 Cora 数据集文件，并在需要时将其集成到机器学习或图神经网络任务中。
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kevin的博客
05-20 2994
最近看GAT的代码使用的是Cora数据，然后小白的我就把一些自己不太懂的地方做上简单标注，以便简单了解大致流程。 数据以及处理方法链接 Core数据在data文件中，处理方法在utils.py中 GAT（pytorch）：Diego999/pyGAT Cora数据集介绍（README翻译） Cora数据集由机器学习论文组成，是近年来图深度学习很喜欢使用的数据集。在数据集中，论文分为以下七类之一: 基于案例 遗传算法 神经网络 概率方法 强化学习 规则学习 理论 论文的选择方式是，在最终语料库中，每篇论文
【PYG】Cora数据集简介
Never Give Up
07-01 2421
通过Planetoid类加载 Cora 数据集，并对特征进行归一化，可以快速方便地准备数据，进行节点分类等任务。PyTorch Geometric 提供的工具使得处理图结构数据变得简单和高效，有助于我们在实际应用中充分利用图神经网络的强大能力。
图神经网络学习——图节点分类（Cora数据集）
Daomiyo的博客
03-05 4960
Cora数据集是一个常用的学术文献引文网络数据集，用于研究文献分类或文献引用关系分析的机器学习任务。该数据集包含了一个关于机器学习领域的学术文献引文网络，以及每篇文献的内容特征和标签信息。由于Cora数据集的规模适中且包含丰富的信息，因此成为了学术界常用的基准数据集之一。：边表示文献之间的引用关系，如果文献A引用了文献B，那么在数据集中会有一条从节点A指向节点B的边。：每个节点还包含了关于文献内容的特征，通常是词袋模型中每个单词的出现情况。：Cora数据集中的节点代表学术文献，每个节点有一个唯一的ID。
CORA 数据集 精美可视化+详解 番外篇：PyG框架及Cora数据集简介Obifold Consulting
强化学习曾小健
03-11 4059
CORA 数据集Cora 数据集包含 2708 份科学出版物，分为七类之一。引文网络由 5429 个链接组成。数据集中的每个出版物都由 0/1 值词向量描述，指示词典中相应词的不存在/存在。该词典由 1433 个独特单词组成。该数据集是图学习中的 MNIST 等价物，我们在其他文章的功能中明确地探索它，一次又一次地使用该数据集作为测试平台。下载并解压，以这edgelist是一个简单的表格，其中source引用了target因此一个节点是每个节点都有一个subject5行×1434列。
图数据集之cora数据集介绍- 用pyton处理 - 可用于GCN任务
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文章目录cora数据集- 下载地址cora数据集- 内容介绍cora数据集- 用python处理1.导入数据2.将论文的编号转化为[0,2707]3.提取词向量，成为特征矩阵4.提取标签，进行独热编码5.导入论文引用数据6. 创建邻接矩阵参考 cora数据集- 下载地址 https://linqs-data.soe.ucsc.edu/public/lbc/cora.tgz cora数据集- 内容...
GNN常用数据集之Cora数据集
The Thinker
01-02 3万+
在学习图神经网络 GNN 之前，必然要了解一些GNN的常用数据集，这篇博客主要以Cora数据集为例介绍GNN的数据集格式与读取方式，并以一个项目实例进行说明。 GNN常用数据集：https://linqs.soe.ucsc.edu/data 1. Cora数据集介绍 Cora数据集下载地址：https://linqs-data.soe.ucsc.edu/public/lbc/cora.tgz 以...
图数据集之cora数据集介绍 --- 适用于GCN任务
摩登都市天空---专栏
04-12 1万+
一 cora数据集- 内容介绍 cora数据集- 下载地址 https://linqs-data.soe.ucsc.edu/public/lbc/cora.tgz 样本特征，标签，邻接矩阵 该数据集共2708个样本点，每个样本点都是一篇科学论文，所有样本点被分为8个类别，类别分别是1）基于案例；2）遗传算法；3）神经网络；4）概率方法；5）强化学习；6）规则学习；7）理论 每篇论文都由一个1433维的词向量表示，所以，每个样本点具有1433个特征。词向量的每个元素都对应一个词，且该元素只有...
Cora数据集：使用Planetoid加载教程
资源摘要信息:"Cora数据集是一个广泛使用的机器学习数据集，特别是在图神经网络（GNN）和图分类的研究中。它由斯坦福大学的一个研究小组创建，旨在用于测试不同的机器学习模型在图结构数据上的性能。由于其公开和...
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