rosetta软件_分子模拟软件Discovery Studio详细图文教程合集（上）

Discovery Studio™ (简称DS)是专业的生命科学分子模拟软件，DS目前的主要功能包括：蛋白质的表征（包括蛋白-蛋白相互作用）、同源建模、分子力学计算和分子动力学模拟、基于结构药物设计工具（包括配体-蛋白质相互作用、全新药物设计和分子对接）、基于小分子的药物设计工具（包括定量构效关系、药效团、数据库筛选、ADMET）和组合库的设计与分析等。

三个月的时间中，利刃君推出Discovery Studio软件教程共二十篇，内容包括分子对接、药效团构建、ADMET性质预测、同源建模、氨基酸突变等，当然后续还会继续更新，为了方便大家查看往期教程，利刃君这里对前二十篇教程进行整理。

体系准备专题

不论是分子对接或药效团的构建等，小分子配体与蛋白受体的预处理都是必不可少的。

本部分教程主要为配体-受体体系的预处理以及受体结合位点的定义。可通过点击下方图片进行查看：

①小分子及蛋白准备

利刃君：分子模拟软件Discovery Studio教程（一）：小分子配体及蛋白准备​zhuanlan.zhihu.com

分子对接专题

分子对接就是把配体分子放在受体活性位点的位置，然后按照几何互补、能量互补以及化学环境互补的原则来实时评价配体与受体相互作用的好坏，并找到两个分子之间最佳的结合模式。本部分教程包括精准分子对接、全柔性受体-配体对接以及分子对接后的构象分析。可通过点击下方图片进行查看：

①精准分子对接技术（CDOCKER）

利刃君：分子模拟软件Discovery Studio教程(二)：精准的分子对接技术​zhuanlan.zhihu.com

②全柔性受体-配体对接技术

利刃君：分子模拟软件Discovery Studio教程(三)：全柔性受体-配体对接技术​zhuanlan.zhihu.com