内容简介
本书实例意在解决生物学问题,通过"编程技法”的形式,涵盖尽可能多的组织、分析、表现结果的策略。在每章结尾都会有为生物研究者设计的编程题目,适合教学和自学。本书由六部分组成:Python语言基本介绍,语言所有成分介绍,高级编程,数据可视化,生物信息通用包Biopython,最后给出20个"编程秘笈”,范围涵盖了从二级结构预测、多序列比对到蛋白质三维结构的广泛话题。此外,本书附录还包括了大量的生物信息常用资源的信息。
教材特色
该书是面向生物学读者的编程好书之一。随着高通量技术(例如DNA微阵列或DNA/RNA测序)的改进,生物数据量正在迅速增长。管理和分析生物数据的需求越来越多,编程技术的应用将成为标准做法。Python由于其功能强大,语言优雅简单,成为提高编程技能的优秀工具!本书以Python数据管理为核心,主题广泛,结构合理,各章相互依赖程度低,便于读者自定学习的切入点。
作者清晰地诠释了Python在数据管理(解析数据记录、过滤和排序数据)与数据可视化(使用Python接口R)中的应用。本书还提供了模块化编程的描述,引导读者编写简单的函数,通过编写类而构建程序流程……一切都按照Python编码标准和易于提高的方式进行。
对于面临计算挑战的生物学家和从业者,本书既适合Python入门学习,又可助力中级Python用户学习一些新的技巧,进而在自己的代码中实现。书中实例意在解决生物学问题,通过“编程技法”的形式,涵盖尽可能多的组织、分析、表现结果的策略。在每章结尾都会有为生物研究者设计的编程题目,适合教学和自学。本书由六部分组成:Python语言基本介绍,语言所有成分介绍&