python 凝聚层次聚类_python - 如何对视频轨迹的速度进行凝聚层次聚类？ - 堆栈内存溢出...

我有二维数据提到帧数和轨迹速度。 例如，这是我的数据：

array([[[ 1. , 0.83025005]],

[[ 1. , 0.83025005]],

[[ 1. , 0.83025005]],

...,

[[165. , 0.21587787]],

[[165. , 0.21587787]],

[[165. , 0.21587787]]])

在绘制这些速度特征时，我得到了以下结果。

为此，我想进行分层聚类以获得以下类型的输出：

我想使用分层聚类制作三个聚类。 数据形状是

TrajData.shape

(213885, 2)

对于这样的集群，我从scipy.cluster.hierarchy导入树形图，链接导入

然后，在上一个图之后我使用以下内容：

Z=linkage(TrajData,'ward')

Following error generated:

MemoryError Traceback (most recent call last)

in

----> 1 Z=linkage(TrajData,'ward')

~/miniconda3/envs/himal/lib/python3.7/site-packages/scipy/cluster/hierarchy.py in linkage(y, method, metric, optimal_ordering)

1102 'matrix looks suspiciously like an uncondensed '

1103 'distance matrix')

-> 1104 y = distance.pdist(y, metric)

1105 else:

1106 raise ValueError("`y` must be 1 or 2 dimensional.")

~/miniconda3/envs/himal/lib/python3.7/site-packages/scipy/spatial/distance.py in pdist(X, metric, *args, **kwargs)

1983 out = kwargs.pop("out", None)

1984 if out is None:

-> 1985 dm = np.empty((m * (m - 1)) // 2, dtype=np.double)

1986 else:

1987 if out.shape != (m * (m - 1) // 2,):

MemoryError:

如何进行分层聚类以找到三个聚类？