生信分析电脑推荐_C3和C4植物中PEPC的生物信息学分析

C3

和

C4

植物中

PEPC

的生物信息学分析

摘要：

ＰＥＰＣ是Ｃ４光合途径中的关键酶之一，

为研究Ｃ３和Ｃ４植物ＰＥＰ

Ｃ功能上的差异，

利用一系列的生物信息学软件分别分析了４种Ｃ３和Ｃ４植物

ＰＥＰＣ基因编码蛋白的氨基酸组成、等电点、结构域、二级结构、空间结构等

性质，

并进行两类植物蛋白质的比对。

结果表明，

ＰＥＰＣ基因编码蛋白为不稳

定蛋白质；

二级结构主要是以无规则卷曲为主。

同时揭示出Ｃ３和Ｃ４植物ＰＥ

ＰＣ存在一定差异。

用ＥＳｙＰｒｅｄ３Ｄ的建模服务器进行ＰＥＰＣ结构的三

维建模，预测得到一个同源性较高的蛋白质结构数据１ＪＱＯ

ｃｈａｉｎ

Ａ，

同源性为９９．

７％，

从而构建目标序列的三级结构。

利用ＰＲＯＣＨＥＣＫ对

建模结果进行检测，

模拟得到的玉米ＰＥＰＣ蛋白质的三维结构的氨基酸残基有

９４．

２％位于Ｒａｍａｃｈａｎｄｒａｎ点图中合理区域，

模拟得到的玉米Ｐ

ＥＰＣ的三维结构是可靠的。

关键词：Ｃ３植物；Ｃ４植物；ＰＥＰＣ；生物信息学

Ａｂｓｔｒａｃｔ：

Ｔｏ

ｅｘｐｌｏｒｅ

ｔｈｅ

ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ

ｄｉｆｆｅｒｅｎｃｅｓ

ｂｅ