python图像库_科学网—python的图像处理库 - 吴景鹏的博文

Matlab是一个商业软件,现在后悔一开始学习Matlab了。想慢慢转移到python平台,找找有哪些图像处理的库。

1. ITK

这是医学图像处理最流行的库了,虽然是使用C++语言编写的,但也提供了齐全的python绑定。在编译的时候,可以选择绑定python。这样就可以直接用python调用ITK函数了。在ubuntu里,源里面就有,直接安装即可。通过import itk即可载入ITK函数库。

另外,为了进一步简化ITK的使用,最近出现了一个SimpleITK的项目。SimpleITK省略了模板的使用,更符合python的编程模式。SimpleITK目前正在开发,还缺少很多库函数,尤其是配准部分,因此,暂时还不能满足我的需求。

2. PIL/Pillow

试用了一下,感觉功能非常简单,而且是针对二维图片设计的,显然无法满足我们处理海量图像数据集的需要。

结论:不能满足需求。

官方网站:

教程:

3. VIGRA

针对多维图像数据集设计,而且有很强的并行能力。其中的数据结构可以在python和C++之间无缝转换!这个软件维护还比较活跃,最新版是13年11月。

关键是有应用案例,处理的是海量的电镜成像神经元结构数据集,这点与我的职业发展方向吻合!展示的图片中显示了优美的三维结构,也表明软件处理结果可以完美地展现。

缺点:缺乏配准功能模块。

结论:值得深入研究。

官方网站:

介绍的ppt

基于这个库,衍生出了一个软件ilastik

4. Medpy

由著名的LOLI开发,满足海量高维图像处理的需求,其中核心的应用是图割分割。Medpy基于Python-ITK,属于ITK以上的高级库吧。另外,Medpy是一个很好的学习怎么用python玩转ITK的例子,可以看Medpy的代码来学习怎么用Python-ITK。

主页,其中有ITK的编译和配置步骤(解决了一个ITK的bug)

5. openCV

openCV是计算机视觉领域的开源库,主要是处理视频的,因此,多维图像处理方面还不是特别适合。但是openCV的目标是实时的视频处理,因此,里面的函数计算速度都很快,可以用于二维图像的快速处理,而且有很多基本的函数,用于预处理和特征提取还是非常合适的。

python-opencv可以直接在ubuntu源里面安装,调用方式是import cv2

python-opencv官方教程

这个教程虽然是对应opencv3的,但大部分内容对目前的2.X也适用(亲测可用)。

6. IRTK (Image Registration toolkit)

顾名思义,IRTK主要是用于配准的。作者并没有基于ITK,而是自己实现很多基本图像处理和配准的函数。根据作者的解释,这个工具包相对于ITK和SimpleITK的优点就是调用简单!如果是这样的话,学这个工具还不如学习更为通用的ITK了。

官方网站

python调用的方法

7. (Astronomical) Image Registration

同样是基于python的,但主要是面对天文成像图片的。根据作者的描述,特点是可以适应对比度差异大的图像间配准。

在2012年,一帮图像处理牛人搞了个会议,讨论并且推动大家从Matlab转到python平台,并且做了很好的总结。

有很多文件可以从会议的网站下载到

包括一个演讲的ppt,相当于做了个完整的综述

用python调用openCV的例子

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转载本文请联系原作者获取授权,同时请注明本文来自吴景鹏科学网博客。

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ForkJoin框架可以用于处理集合的任务。在使用ForkJoin框架处理集合时,可以将集合分割成多个子任务,每个子任务负责处理集合的一部分。这样可以利用多线程并行地处理集合,提高处理效率。 具体地,可以使用ForkJoinTask来表示集合的处理任务,其中的compute方法用于实现具体的处理逻辑。可以使用RecursiveAction来表示无返回值的任务,使用RecursiveTask来表示需要返回值的任务。 在使用ForkJoin框架处理集合时,需要注意任务切分的粒度。切分得太小可能会导致任务切换的开销大于并行处理的收益,切分得太大可能无法充分利用多线程的优势。因此,需要根据具体情况选择适当的切分粒度。 此外,需要注意判断是否需要使用ForkJoin框架。如果集合的任务量不是很大,串行处理可能比并行处理更高效,因为多线程会涉及到上下文的切换开销。 总之,使用ForkJoin框架可以实现多线程并行地处理集合,提高处理效率。但在使用时需要注意任务切分的粒度和是否适合使用ForkJoin框架。 #### 引用[.reference_title] - *1* *2* *3* [Fork/Join](https://blog.csdn.net/wangmourena/article/details/110097754)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^control_2,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item] [ .reference_list ]
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