树复制替换id_MEGA构建系统发育树，以及EvolView & iTOL 的入门心得.

最近在做这个，也不是很会，就当是记录一点学习心得了；如果有错误的地方，请指正。哈哈。

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1.如何使用MEGA创建进化树？

古话说得好，巧妇难为无米之炊（我还想补充一句，巧妇也难为无灶之炊），嘛意思，就是我们首先要准备好自己的序列，当然还有MEGA软件。

1.1序列处理

比对之前，我已经把序列做成了自己想要的样子，主要是名字，名字，名字（懒得后面改了，本文也会说到怎么批量修改ID）

对，没错，用记事本，小本本记下来，每个名字给他带上帽子“>”。排排坐，好准备比对。如果，你前期没把名字改好，那么后期输出PDF格式文件，也可以编辑的，包括字体。

输完序列，当然要保存文件啦，这里我们把记事本文件保存为fasta：文件—另存—保存类型（所有文件）—文件名（XXXXX.fasta)—保存

1.2打开MEGA建树

选择Open A File ，打开刚刚保存的fasta文件。

之后选择Alignment---Align by clustalW----Select all