直系同源基因ks_Nature|睡莲基因组和早期有花植物的进化

今天给大家介 绍一篇睡莲基因组的文章，这篇文章去年十月底在 nature 在线发表。 感兴趣的小伙伴可以在原文的补充材料中继续查看。 睡莲基因组和早期有花植物的进化 睡莲属于早期的被子植物Nymphaeales(睡莲目)。无油樟目，睡莲目和木兰藤目Amborellales, Nymphaeales and Austrobaileyales共同被称作被子植物ANA-基部支群，这是最早的谱系代表，即从现存的核心被子植物(mesangiosperms，也称core angiosperms)谱系中最早分化出来的谱系。本文报导了409Mb蓝星睡莲( Nymphaea colorata)的基因组。系统发育分析支持无油樟目和睡莲目是其他现存被子植物的 一个连续successive姊妹群 。 蓝星睡莲和其他19个转录组揭示了睡莲目的全基因组复制事件，这一复制事件可能在睡莲科和莼菜科(Nymphaeaceae and Cabombaceae)都共享。 这些在全基因组复制事件中保留下来的同源的(homologues)基因在调节花期和花发育上具有重要作用。在蓝星睡莲中扩展的ABCE直系同源基因可能支持了ABCE模型在早期的被子植物花器官中已经确定 。睡莲已经进化出了诱人的花香和花色(即传粉综合症)，这些特征与核心被子植物共享，并且注释了蓝星睡莲中这些生物合成的基因。化学化合物和植物气味背后的生物共线性基因暗示在核心被子植物中具有平行进化模式。由于蓝星睡莲独特的系统发育位置，蓝星睡莲的基因组能够揭示早期被子植物的进化。 主要结果 许多睡莲物种尤其是睡莲属(睡莲科)都有大的艳丽的花，和其他被子植物(也称有花植物)一样。它们的美丽吸引着如莫奈等一大批艺术家。睡莲的花被片(即外部的花器官)的分化能力有限，但是它们拥有雌雄器官，并且具有不同的气味和颜色。类似于很多核心被子植物(核心被子植物，包括双子叶植物，单子叶植物和木兰类植物core angiosperms, including eudicots, monocots, and magnoliids)补充记录1.另外，一些水生睡莲生活史很短，具有很多种子，且ANA作为被子植物基部支群，睡莲是研究被子植物进化事件的理想的材料。特别是蓝星睡莲基因组较小(2n=28,大小约400Mb)，并且蓝色的花瓣使它在育种上也变得特别。补充记录1 报告了 N. colorata的测序基因组，利用了PacBio RSII single-molecule real-time (SMRT)测序方法。组装了1429个contigs(C