pydicom读取头文件_python 读取dicom文件,生成info.txt和raw文件的方法

本文介绍了如何使用Python的pydicom库读取DICOM文件,提取信息并生成info.txt,同时按位置排序保存原始数据为raw文件。文章中提到了pydicom版本差异及Python IO操作的注意事项。
摘要由CSDN通过智能技术生成

目标:利用python读取dicom文件,并进行处理生成info.txt和raw文件

实现:通过pydicom读取dicom文件

代码:

import numpy

import pydicom

import os

# dicom文件所在的文件夹目录

PathDicom = '/home/lk/testdata/1.3.6.1.4.1.9328.50.1.42697596859477567872763647333745089432/'

# 筛选出文件夹目录下所有的dicom文件

lstFilesDCM = []

for dirName, subdirList, fileList in os.walk(PathDicom):

for filename in fileList:

if '.dcm' in filename.lower():

lstFilesDCM.append(os.path.join(dirName, filename))

# Get ref file

RefDs = pydicom.read_file(lstFilesDCM[0])

# Load dimensions based on the number of rows, columns, and slices (along the Z axis)

ConstPixelDims = (int(RefDs.Rows), int(RefDs.Columns), len(lstFilesDCM))

# Load spacing values (in mm)

ConstPixelSpacing = (float(RefDs.PixelSpacing[0]), float(Ref

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