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本文旨在利用3DμCT图像量化小麦籽粒生长阶段的形态变化,植物表型资讯介绍如下:
小麦是世界范围内人类主要粮食作物之一,也是动物饲料以及工业原料最重要的来源之一。为了应对全球日益增长的人口需求,通过增加单粒重提高粮食产量被认为是一种可行的解决方案。小麦籽粒形态分析在追踪和理解小麦籽粒发育过程中起着重要作用,并且能够通过预估小麦籽粒特性、大小和外形的潜在影响决定最终籽粒重量。X射线微型计算机断层扫描(μCT)是一款非常强大且非侵入性成像工具,可以获取单个小麦籽粒3D图像,从而评估小麦籽粒及其不同皮层的形态。本文旨在利用3DμCT图像量化小麦籽粒生长阶段的形态变化。
μCT图像采集和图像分析的实验设计流程图
研究人员采集了小麦籽粒不同发育阶段60-360°DAA 3DμCT图像,并开发了能够稳健识别小麦籽粒内、外组织的方法,之后利用3DμCT图像提取小麦籽粒形态特征。另外,研究人员还开发了一个量化小麦籽粒腹沟形态的工作框架。实验结果表明:1)可以实现小麦籽粒的半自动分割,隔室容积的变化充分说明了小麦籽粒发育的不同阶段;2)小麦籽粒内部孔隙的变化过程反映了外部组织裂解和内部组织生长情况;3)可以对小麦籽粒腹沟形状进行量化,并对每个发育阶段的腹沟形状平均化,从而有助于了解小麦籽粒形状的成因。
小麦籽粒的形态测量指标
μCT切片上小麦腹沟检测工作流程
小麦内、外组织在几个发育阶段的分割结果
综上所述,μCT采集和图像处理方法是提取小麦籽粒形态参数的有力工具,能够定量分析小麦籽粒生长的显著特征。另外,研究人员提出进一步的工作将集中于建立基于真实3D成像数据的小麦籽粒生长计算模型。
小麦籽粒发育过程中的形态学
沿小麦籽粒长度所有样品腹沟深度值的分布
来源:
Le T D Q , Alvarado C, Girousse C, et al. Use of X-ray micro computed tomography imaging to analyze the morphology of wheat grain through its development. Plant Methods(2019). https://doi.org/10.1186/s13007-019-0468-y.
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