ggplot2箱式图两两比较_第五十六讲：R作图ggplot2绘制箱式图

这一讲，我们将介绍如何用ggplot2软件包中的函数geom_boxplot()绘制复杂箱式图。1. 概论

函数geom_boxplot()简化格式为：

geom_boxplot(outlier.colour="black", outlier.shape=16,outlier.size=2, notch=FALSE)

·Outlier.colour, outlier.shape, outlier.size：分别表示离群点的颜色，形状和大小。

·notch：逻辑值。如果为TRUE，则绘制一个缺口箱式图。缺口在中位数及其置信区间，该置信区间通常基于中位数+/- 1.58 * IQR / sqrt(n)。缺口用于比较组；如果两个箱式的缺口不重叠，则有力证明中位数不同。

2. 准备数据

使用R内置的ToothGrowth数据集：

# 将可变剂量从数字转换为因子变量ToothGrowth$doseas.factor(ToothGrowth$dose)head(ToothGrowth)

输出结果：

   len supp dose 1  4.2   VC 0.5 2 11.5   VC  0.5 3  7.3   VC 0.5 4  5.8   VC 0.5 5  6.4   VC 0.5 6 10.0   VC 0.5

确保使用上述R脚本将变量剂量转换为因子变量。

3. 基本箱式图

library(ggplot2)# 基本箱式图，将基本箱式图保存在p中p<-ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len))+geom_boxplot() #表示对ggplot()函数中绘图内容进行geom_boxplot()函数运算p #打印基本箱式图，即输入p# 转置箱式图p+coord_flip()# 绘制缺口箱式图ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len))+geom_boxplot(notch=TRUE)# 更改离群值的颜色、形状和大小ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len))+geom_boxplot(outlier.colour="red", outlier.shape=8,outlier.size=4)