r语言进行go富集分析_GO富集柱状图

分析模块，输入差异基因GO富集分析结果，由分析模块“GO Enrichment Analysis”生成，输出GO富集结果柱状图。

输入：

差异基因GO富集分析结果文件，由分析模块“GO Enrichment Analysis”生成。

示例：

id      enrichment        description        ratio_in_study   ratio_in_pop     p_uncorrected   p_bonferroni    p_holm     p_sidak    p_fdr         namespace       genes_in_study

GO:0019843     e       rRNA binding    23/342      38/3357   2.62e-07   0.000774 0.000774 0.000755 n.a.   molecular_function         BM590_A2173;BM590_A1223;BM590_A1221;……

GO:0043228     e       non-membrane-bounded organelle   28/342      67/3357   2.86e-07   0.000847 0.000847 0.000826 n.a.         cellular_component BM590_A2173;BM590_A1223;BM590_A1221;……

GO:0043043     e       peptide biosynthetic process     34/342      67/3357   2.86e-07   0.000847 0.000847 0.000826 n.a.         biological_process    BM590_A2173;……

……

GO:0046394     p       carboxylic acid biosynthetic process          1/342        94/3357   0.000775 1       1       1       n.a.   biological_process         BM590_B0462

……

输出：

GO富集结果柱状图(只针对“ e ”，显著富集的结果进行作图)。

示例：

注：横轴表示富集到的差异基因数目，对于GO:0019843，为23；纵坐标表示富集到的GO Term功能描述；不同颜色代表不同的GO三大类(分子功能、细胞组成、生物过程)。

分析模块引用R语言(v3.2.1)ggplot2包(v2.2.1)中的geom_bar相关功能进行GO富集柱状图的绘制。