荧光平均值计算matlab,科学网—使用Image J进行自动荧光定量分析 - 陆绮的博文...

在这里我整理我最近使用ImageJ软件自动数细胞以及定量分析荧光强度的步骤.

ImageJ的主面板:

打开文件

File ￫ Open ￫’.zvi’

先把2D的所有图叠加起来,选项选max intensity

Image ￫stacks ￫ 3D project

复制一张图:

Image ￫duplicate

调整Thereshold,实际上是选择想要纳入计算的细胞的区域,选定的区域会用红色高亮标记:

Image ￫Adjust ￫ Threshold

如果觉得背景太强可减去背景:

Process ￫ Subtractbackground

当红色高亮标的斑块就是想要的细胞时,点击Apply

Image ￫Adju