gels imagej 图片处理_如何用ImageJ分析运动细胞?

本文详细介绍了如何利用ImageJ(Fiji)软件分析运动细胞的图片序列,包括打开图片序列、转为灰度图片、二值化、追踪细胞及计算细胞运动轨迹等步骤,帮助研究人员理解细胞迁移的过程。
摘要由CSDN通过智能技术生成

ImageJ(官网:https://imagej.nih.gov/ij/)是一个基于java的公共的图像处理软件,它是由National Institutes of Health(NIH)开发的一款功能强大的免费软件,在生物及医学图像分析中起着非常重要的作用。

细胞是生命世界的基础,构成组织和器官。机体内有些细胞可以快速移动发生迁移,例如小胶质细胞在中枢神经系统出现组织损伤时将释放ATP,小胶质细胞上受体(例如P2Y12受体)能够感知这种变化从而使突起向着组织损伤的部位运动,对侧的突起回缩。

接下来胞体也向着损伤部位运动并逐渐转变为巨噬细胞发挥吞噬功能。了解细胞迁移的方式和原因,可以为科学家提供新的方法来调控这些细胞。Imagej软件作为一款NIH开发的免费开源软件,不仅可以分析二维图片和三维图片这类静态图片,也可以分析运动的动态图像序列。

Fiji(Fiji is just Imagej,Fiji是预装了诸多生物学插件的Imagej)软件下载地址:http://imagej.net/Fiji/Downloads 。

分析步骤:

1.打开Fiji软件,File,Import,Image Sequence,打开运动细胞的图片序列,打开其中任何一张:

8547fd2fdc690c6ae606e8e7738dd417.png

进入以下界面:

904f7f38be8b6cfa79916e7fe735c13b.png

运动细胞的图片序列共45张图片(Number of images)导入数据。从第一张图像开始导入(Starting image);ncrement为1,代表增幅为1及不跳过任何图片,Sort names numerically 按照数字序号排列,点击OK:

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