python计算相对分子质量_计算化学网文highlights

北京科音自然科学研究中心(http://www.keinsci.com)设立的“北京科音”微信公众号每个月月末汇总推送一次当月发布在计算化学公社论坛(http://bbs.keinsci.com)、思想家公社blog(http://sobereva.com)等地方的较有价值的计算化学文章和帖子。为了便于非订阅用户查看，在本页面也同步发布。内容既有Sobereva写的，也有别人写的。

下为2020年11月的内容

下为2020年10月的内容

下为2020年9月的内容

下为2020年8月的内容

• Multiwfn 3.7正式版隆重发布！

http://sobereva.com/566

• 调用Multiwfn批量产生cube的脚本MCubeGen 1.0

http://bbs.keinsci.com/thread-18745-1-1.html

• 给sob老师的gau_orca添加额外的功能

http://bbs.keinsci.com/thread-18782-1-1.html

• 使用G16的external调用G16(无限套娃)

http://bbs.keinsci.com/thread-18901-1-1.html

• 使Gaussian在几何优化时包含Grimme's gCP

http://bbs.keinsci.com/thread-18940-1-1.html

• 完整版的Szabo Modern Quantum Chemistry习题解答

http://bbs.keinsci.com/thread-18981-1-1.html

• Gaussian-ORCA-xTB联用进行ONIOM计算

http://bbs.keinsci.com/thread-19003-1-1.html

• Gaussian做二聚体的刚性扫描辅助程序

http://bbs.keinsci.com/thread-18902-1-1.html

• 使用MolAICal的深度学习模型和经典算法程序进行GCGR的从头药物设计

http://bbs.keinsci.com/thread-18873-1-1.html

• 使用MolAICal计算纳米管和蛋白质半径的教程

http://bbs.keinsci.com/thread-18872-1-1.html

• 使用MolAICal计算分子合成可行性预测、类药五原则和PAINS的教程

http://bbs.keinsci.com/thread-18904-1-1.html

• 使用PyInstaller打包深度学习模型“AIGenMols”的例子

http://bbs.keinsci.com/thread-18898-1-1.html

• 使用MolAICal进行药物的QSAR计算

http://bbs.keinsci.com/thread-18896-1-1.html

• 使用MolAICal计算配体和受体结合能力的vinardo打分函数

http://bbs.keinsci.com/thread-18916-1-1.html

• 使用MolAICal进行配体相似性比较或搜索的操作教程

http://bbs.keinsci.com/thread-18917-1-1.html

• 计算小分子诱导蛋白构象变化的Potential of Mean Force(PMF)

http://bbs.keinsci.com/thread-18914-1-1.html

下为2020年7月的内容

下为2020年6月的内容

下为2020年5月的内容

下为2020年4月的内容

下为2020年3月的内容

• 正确地认识分子的能隙(gap)、HOMO和LUMO

http://sobereva.com/543

• 机器学习实例介绍

http://bbs.keinsci.com/thread-16600-1-1.html

• 使用量子化学程序基于簇模型计算金属表面吸附问题

http://sobereva.com/540

• 使用键级密度(BOD)和自然适应性轨道(NAdO)图形化研究化学键

http://sobereva.com/535

• 使用Multiwfn图形化展示分子动力学模拟体系中的孔洞、自由区域

http://sobereva.com/539

• 在ORCA中做counterpoise校正并计算分子间结合能的例子

http://sobereva.com/542

• 使用Multiwfn计算各种与信息论相关的量(information-theoretic quantities)

http://sobereva.com/537

• 基于Fortran使用Levenberg-Marquardt算法做非线性拟合

http://sobereva.com/541

• 无需导数的局部极小化算法NEWUOA在FORTRAN中的使用简例

http://sobereva.com/536

• L-BFGS-B局部极小化算法在Fortran中的使用简例

http://sobereva.com/538

• 对ORCA用户大幅节约Multiwfn做分子表面静电势分析耗时的方法

http://bbs.keinsci.com/thread-16499-1-1.html

• Zen2下linux和win中ORCA的速度和并行效率测试

http://bbs.keinsci.com/thread-16567-1-1.html

• 将Gaussian格式自定义基组转化成ORCA格式的程序

http://bbs.keinsci.com/thread-16605-1-1.html

• LAMMPS_AMD/NVIDIA_GPU版本编译初探

http://bbs.keinsci.com/thread-16612-1-1.html

• 提取Gaussian柔性扫描每一步结构的小程序

http://bbs.keinsci.com/thread-16684-1-1.html

下为2020年2月的内容

下为2020年1月的内容：

下为2019年12月的内容：

• 使用PSI4做对称匹配微扰理论(SAPT)能量分解计算

http://sobereva.com/526

• 通过轨道离域指数(ODI)衡量轨道的空间离域程度

http://sobereva.com/525

• 一篇最全面、系统的研究新颖独特的18碳环的理论文章

http://sobereva.com/524

• 将Multiwfn计算的键级直接标注在分子结构图上的方法

http://sobereva.com/523

• 用PyMOL渲染HSV混色模式的RDG填色等值面图

http://bbs.keinsci.com/thread-15756-1-1.html

下为2019年11月的内容：

下为2019年10月的内容：

下为2019年9月的内容：

下为2019年8月的内容：

下为2019年7月的内容：

下为2019年6月的内容：

• “Multiwfn与波函数分析简介”幻灯片2019版

http://bbs.keinsci.com/thread-13731-1-1.html

• 详谈Multiwfn产生ORCA量子化学程序的输入文件的功能(建议所有ORCA用户一读！)

http://sobereva.com/490

• 考察分子磁感生电流的程序GIMIC 2.0的使用(含24分钟演示视频)

http://sobereva.com/491

• 适合理论、计算化学投稿的期刊及其2018年影响因子(2019年6月公布)

http://sobereva.com/492

• 绘制静电势全局极小点+等值面图展现孤对电子位置的方法

http://sobereva.com/493

• 谈谈该从Gaussian输出文件中的什么地方读电子能量

http://sobereva.com/488

• 对AICD包进行修改以使之适用于Gaussian 16

http://bbs.keinsci.com/thread-13577-1-1.html

• Gaussian16里用PBE0关键词计算的实际上是PBE0-DH双杂化泛函

http://bbs.keinsci.com/thread-13660-1-1.html

下为2019年5月的内容：

下为2019年4月的内容：

下为2019年3月的内容：

下为2019年2月的内容：

下为2019年1月的内容：

下为2018年12月的内容：

下为2018年11月的内容：

下为2018年10月的内容：

文献推荐

• GFN2-xTB的手稿发布了(http://bbs.keinsci.com/thread-11204-1-1.html)

• Nature Materials上一篇关于氧化态概念讨论的论文(http://bbs.keinsci.com/thread-11027-1-1.html)

• Modeling of Organic Light Emitting Diodes: From Molecular to Device Properties(http://bbs.keinsci.com/thread-11113-1-1.html)

下为2018年9月的内容：

文献推荐

• Donald Truhlar的revM06(http://bbs.keinsci.com/thread-10931-1-1.html)

• Theory and Calculation of the Phosphorescence Phenomenon(http://bbs.keinsci.com/thread-10884-1-1.html)

• A Bayesian Approach to Predict Solubility Parameters(http://bbs.keinsci.com/thread-10871-1-1.html)

• Stefan Grimme 今年发表的研究离子液体的文章(http://bbs.keinsci.com/thread-10828-1-1.html)

下为2018年8月的内容：

下为2018年7月的内容：

下为2018年6月的内容：

下为2018年5月的内容：