ggplot2中显示坐标轴_ggplot2|绘制GO富集柱形图

生信分析中经常会得到一些基因,然后做GO富集分析,达到对基因进行注释和分类的目的。

本文利用R语言的ggplot2包,从头带您绘制可发表级别的GO富集分析结果图。

一 载入数据集和R包

利用各种生信工具得到富集分析结果,数据列可能不一致,但关键几列都有。

library(ggplot2)data "GO_enrichment_significant.csv",header=TRUE)head(data)

f3bd639a73ae024e2d7d31f7577c98fe.png

二 GO结果绘制基础bar图

参照之前ggplot2使用方法,更改geom即可绘制简单的bar图,按照GO_category分组颜色

ggplot(data=data, aes(x=GO_term,y=Num_of_symbols_in_list_in_GO, fill=GO_category)) + geom_bar(stat="identity", width=0.8)

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