ggplot2画GO富集柱状图

这篇博客介绍了如何利用ggplot2对get113.csv文件中的GO富集数据进行处理和排序,分别展示了横版和竖版的柱状图。横版数据按MF、CC、BP的GeneNumber升序排列,竖版则按BP、CC、MF的GeneNumber降序排列。作者还提到了主题设置参考的两篇文章,并展示了最终的图表执行效果。
摘要由CSDN通过智能技术生成

使用的get113.csv文件格式:
Description,GeneNumber,GO_Function
biologl_pro,8,biological_process

biologl_pro,8,biological_process

画图前先对所用数据进行排序处理
横版的数据为MF,CC,BP;每组数据都是GeneNumber升序,代码如下:

dat <- read.csv("gst11 vs wt go.csv",header=TRUE)
bp=dat[which(dat$GO_Function %in% "biological_process"),]
library(dplyr)
newbp=arrange(bp,bp[,2])
cc=dat[which(dat$GO_Function %in% "cellular_component")
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