python数组 swig_如何使用SWIG将numpy数组转换为vector <int>＆(reference) - python

我的目标：

在python中创建3个numpy数组(其中2个将使用特定的值初始化)，然后将所有三个通过swig发送到c ++函数中作为矢量引用(这是为了避免复制数据和失去效率)。一旦进入c ++函数，就将两个数组相加，并将它们的总和放在第三个数组中。

vec_ref.h

#include

#include

void add_vec_ref(std::vector& dst, std::vector& src1, std::vector& src2);

vec_ref.cpp

#include "vec_ref.h"

#include // need for size_t

#include

void add_vec_ref(std::vector& dst, std::vector& src1, std::vector& src2) {

std::cout << "inside add_vec_ref" << std::endl;

assert(src1.size() == src2.size());

dst.resize(src1.size());

for (size_t i = 0; i < src1.size(); i++) {

dst[i] = src1[i] + src2[i];

}

}

vec_ref.i

%module vec_ref

%{

#define SWIG_FILE_WITH_INIT

#include "vec_ref.h"

%}

%include "numpy.i"

%init %{

import_array();

%}

%include "std_vector.i"

%template(vecInt) std::vector;

// %template(vecIntRef) std::vector &;

// %apply (std::vector * INPLACE_ARRAY1, int DIM1) {(std::vector * dst, int a),(std::vector * src1, int b),(std::vector * src2, int c)};

// %apply (std::vector * INPLACE_ARRAY1) {(std::vector * dst),(std::vector * src1),(std::vector * src2)};

// %apply (std::vector & INPLACE_ARRAY1) {(std::vector & dst),(std::vector & src1),(std::vector & src2)};

// %apply (std::vector & INPLACE_ARRAY1, int DIM1) {(std::vector & dst, int a),(std::vector & src1, int b),(std::vector & src2, int c)};

%include "vec_ref.h"

生成文件

all:

rm -f *.so *.o *_wrap.* *.pyc *.gch vec_ref.py

swig -c++ -python vec_ref.i

g++ -O0 -g3 -fpic -c vec_ref_wrap.cxx vec_ref.h vec_ref.cpp -I/home/lmckeereid/tools/anaconda3/pkgs/python-3.7.3-h0371630_0/include/python3.7m/

g++ -O0 -g3 -shared vec_ref_wrap.o vec_ref.o -o _vec_ref.so

测试器

import vec_ref as vec

import numpy as np

a = np.array([1,2,3], dtype=np.intc)

b = np.array([4,5,6], dtype=np.intc)

c = np.zeros(len(a), dtype=np.intc)

print('---Before---\na:', a)

print('b:', b)

print('c:', c)

vec.add_vec_ref(c,a,b)

print('---After---\na:', a)

print('b:', b)

print('c:', c)

输出：

---Before---

a: [1 2 3]

b: [4 5 6]

c: [0 0 0]

Traceback (most recent call last):

File "tester.py", line 12, in

vec.add_vec_ref(c,a,b)

TypeError: in method 'add_vec_ref', argument 1 of type 'std::vector< int,std::allocator< int > > &'

我已经尝试了在vec_ref.i中找到的所有注释掉的％apply和％template指令，但是它们没有用。

有没有我应该包括的一些类型映射？

参考方案

我同意@pschill：如果不复制数据就无法获得std :: vector。

一种替代方法是使用std::span class template(在C ++ 20中引入)，或使用库中定义的类似span类模板。

创建std::span将提供numpy数组中现有数据的视图，并在C ++中提供many convenient member functions(例如operator[]，迭代器，front()，back()等)。

创建范围将永远不会从numpy数组中复制数据。

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