我的目标:
在python中创建3个numpy数组(其中2个将使用特定的值初始化),然后将所有三个通过swig发送到c ++函数中作为矢量引用(这是为了避免复制数据和失去效率)。一旦进入c ++函数,就将两个数组相加,并将它们的总和放在第三个数组中。
vec_ref.h
#include
#include
void add_vec_ref(std::vector& dst, std::vector& src1, std::vector& src2);
vec_ref.cpp
#include "vec_ref.h"
#include // need for size_t
#include
void add_vec_ref(std::vector& dst, std::vector& src1, std::vector& src2) {
std::cout << "inside add_vec_ref" << std::endl;
assert(src1.size() == src2.size());
dst.resize(src1.size());
for (size_t i = 0; i < src1.size(); i++) {
dst[i] = src1[i] + src2[i];
}
}
vec_ref.i
%module vec_ref
%{
#define SWIG_FILE_WITH_INIT
#include "vec_ref.h"
%}
%include "numpy.i"
%init %{
import_array();
%}
%include "std_vector.i"
%template(vecInt) std::vector;
// %template(vecIntRef) std::vector &;
// %apply (std::vector * INPLACE_ARRAY1, int DIM1) {(std::vector * dst, int a),(std::vector * src1, int b),(std::vector * src2, int c)};
// %apply (std::vector * INPLACE_ARRAY1) {(std::vector * dst),(std::vector * src1),(std::vector * src2)};
// %apply (std::vector & INPLACE_ARRAY1) {(std::vector & dst),(std::vector & src1),(std::vector & src2)};
// %apply (std::vector & INPLACE_ARRAY1, int DIM1) {(std::vector & dst, int a),(std::vector & src1, int b),(std::vector & src2, int c)};
%include "vec_ref.h"
生成文件
all:
rm -f *.so *.o *_wrap.* *.pyc *.gch vec_ref.py
swig -c++ -python vec_ref.i
g++ -O0 -g3 -fpic -c vec_ref_wrap.cxx vec_ref.h vec_ref.cpp -I/home/lmckeereid/tools/anaconda3/pkgs/python-3.7.3-h0371630_0/include/python3.7m/
g++ -O0 -g3 -shared vec_ref_wrap.o vec_ref.o -o _vec_ref.so
测试器
import vec_ref as vec
import numpy as np
a = np.array([1,2,3], dtype=np.intc)
b = np.array([4,5,6], dtype=np.intc)
c = np.zeros(len(a), dtype=np.intc)
print('---Before---\na:', a)
print('b:', b)
print('c:', c)
vec.add_vec_ref(c,a,b)
print('---After---\na:', a)
print('b:', b)
print('c:', c)
输出:
---Before---
a: [1 2 3]
b: [4 5 6]
c: [0 0 0]
Traceback (most recent call last):
File "tester.py", line 12, in
vec.add_vec_ref(c,a,b)
TypeError: in method 'add_vec_ref', argument 1 of type 'std::vector< int,std::allocator< int > > &'
我已经尝试了在vec_ref.i中找到的所有注释掉的%apply和%template指令,但是它们没有用。
有没有我应该包括的一些类型映射?
参考方案
我同意@pschill:如果不复制数据就无法获得std :: vector。
一种替代方法是使用std::span class template(在C ++ 20中引入),或使用库中定义的类似span类模板。
创建std::span将提供numpy数组中现有数据的视图,并在C ++中提供many convenient member functions(例如operator[],迭代器,front(),back()等)。
创建范围将永远不会从numpy数组中复制数据。
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