lammps计算聚合物例子_LAMMPS_最佳实践_弹性高性能计算E-HPC - 阿里云

本文介绍了如何在阿里云E-HPC上使用LAMMPS进行聚合物计算。首先,通过远程连接创建作业脚本lammps.pbs和数据文件lj.in,接着使用qsub命令提交作业并监控其状态。作业完成后,可以在用户目录下查看输出文件和日志。
摘要由CSDN通过智能技术生成

命令行提交作业

1. 集群界面,选择“远程连接”按钮,远程登录集群实例,在实例界面右上角选择打开新文件树,用户目录(如:testuser1)下直接创建作业脚本文件lammps.pbs和算例数据文件lj.in(文件内容同上),两个文件均保存在用户目录下,如:/home/testuser1。

创建lammps.pbs作业文件步骤:

打开新文件树-->双击进入home/testuser1目录下-->home文件夹右键新建文件lammps.pbs文件-->创建完之后,双击打开该文件直接编辑脚本内容,然后右上角点击保存即可。

创建lj.in算例数据文件步骤:

打开新文件树-->双击进入home/testuser1目录下-->home文件夹右键新建文件lj.in文件-->创建完之后,双击打开该文件直接编辑内容,然后右上角点击保存即可。

2. 文件保存在目录之后,在当前界面使用如下命令提交并查看作业运行情况:

说明:不能使用root用户登录提交作业。

[testuser1@login0 ~]$ cd ~

[testuser1@login0 ~]$ qsub -N LammpsTestf1 lammps.pbs

0.scheduler

[testuser1@login0 ~]$ qstat -fx 0.scheduler #作业 ID

Job Id: 0.scheduler

Job_Name = LammpsTestf1

Job_Owner = testuser1@scheduler

resources_used.cpupercen

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