感想
自己在“精进”的道路上的一些感想的记录。
今天也是个妖精头子呀
top3读研,生物信息学与脑科学交叉研究方向。
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实验记录 | 7/5
(9:34)正式地坐到了实验室的电脑前,首先理一下今天要汇报给老师的基本思路,然后就是计划这周的主要任务就是要在基础知识上多下功夫(深入研究作者的那篇文章,和我这一个月一直在运行的somatic.pl的代码)。一方面为下周的汇报做准备,另一方面就是在充分的掌握好背景知识之后,才能够帮助我更好的去跑这个流程,我的决心很大。那就集中精力,去加油吧(我是单线程的生物,拒绝干扰)。好的,现在开始。首先就是上次的遗留问题,还没有进一步落实和明确的。我的数据虽然能够覆盖到作者的位点,但是存在大量的“冗余”。有发邮原创 2021-07-06 09:16:07 · 88 阅读 · 0 评论 -
知识积累 | GATK的使用
在mutation calling的过程中,最常使用的一个软件就是GATK,我想要弄明白:(1)GATK能够做什么?(2)GATK如何使用?链接:https://www.plob.org/article/11698.html这个作者实在是太强了。他在文末有分享了这样的一段话:在这里,整篇文章就结束了。如你所见,文章非常长,这里基本包含了WGS最佳实践中的所有内容,但其实我想说的还远不止如此(包括CNV和SV的检测),只是暂时只能作罢了,否则恐怕就没人愿意看下去了,呵呵。在这个WGS主流程的.原创 2021-05-28 13:10:21 · 1750 阅读 · 0 评论 -
关于计算思维的一些没有逻辑的心得
算法是解决问题的方法,比如将10个数按照从小到大的顺序排列,应该怎样去比较?这时,针对于同一个问题会想出不同的解决方案。算法其具体来说,就是一种操作步骤,如打开冰箱,把大象塞到冰箱,关闭冰箱的门。他是有顺序的,并且这一系列的动作组合起来,能够完成一个整体的目标——将大象塞进冰箱。那么这里涉及更具体的——模块化的思维。就是我们在写代码的过程中,不要着急一下子就能够解决问题,而是要去想,如何将大的目标,拆分成具体可执行的步骤,然后再分别的用每一个模块实现,最终将各个部分有机的组合衔接,实现我们整个项目的原创 2021-04-17 15:13:21 · 290 阅读 · 0 评论 -
想要认认真真的夯实基础知识了
今天看了一篇特别有感触的文章。作者(算是前辈了)从零开始自学生物信息学。博客上积累了很多的内容。让我很是钦佩。最近也在读另外一个前辈分享的十年来的从业体验,其中就提到一条是“认真对待自己做的每件事,知识总结,代码整理,文章归纳”。我觉得在这个方面我做的是远远不够的,尤其是最近这几年脱离课堂,脱离最新的前沿,真真正正的自己“打野战”,才明白不断的积累的每天所学的重要性。于是,是真的想要好好夯实基础知识了,毕竟是以后决心要吃“生信”这碗饭的人。现在就在这里悄悄约定,今年(2021年)积累的经验分享的原创 2021-02-22 22:58:47 · 144 阅读 · 0 评论 -
码代码的一点点心得体验
最近越来喜欢上写代码了。觉得超级酷。我觉得可以把计算机当做是自己的合作伙伴。只要逻辑正确,你的合作伙伴永远严格的执行,而且你的这个合作伙伴超级靠谱,超级有逻辑性,工作效率特别高。如果能够掌握一种语言,与计算机去交流,让他去高效的完成你想让他做的事情,该是多么有意思的事情。码代码的过程中和写小说相似,有一种在我眼前的这堆代码中,我是代码之上的背后的控制者,这是我自己统治的领土的感觉。这种控制感实在是超级棒。还想去训练自己的大脑,训练自己的编程能力,去做更多有意思的事。2021/2/原创 2021-02-02 17:07:56 · 389 阅读 · 2 评论