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复杂网络
文章平均质量分 91
假面悍匪王小明
这个作者很懒,什么都没留下…
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PPI网络比对文章汇总
一、已读文章两个网络的:HubAlign:采用重要性节点“Importence”,根据hub节点和瓶颈节点,采用最小度启发式算法进行比对。拓扑较好,生物指标较差。(BioInforMatics)2014论文链接:HubAlign: an accurate and efficient method for global alignment of protein–protein interaction networks | Bioinformatics | Oxford Academic代原创 2021-09-28 20:08:40 · 561 阅读 · 0 评论 -
Blast简介
一、什么是Blastbalst是NCBI中用来将一个蛋白质或DNA序列和各种数据库中的其他序列进行比对的主要工具。Blast探索是研究一个蛋白质和基因的最基本方法之一。二、Blast的运用确定特定的蛋白质或核酸序列有哪些直系同源或旁系同源序列 确定哪些蛋白质和基因在特定物种中出现 确定一个DNA或蛋白质序列身份 发现新基因 确定一个特定基因或蛋白质有哪些已经发现的变种 研究可能存在多种剪切方式的表达基因序列 寻找对于一个蛋白质的功能或结构起关键作用的氨基酸残基..原创 2020-07-30 11:53:19 · 4499 阅读 · 0 评论 -
二分图匹配
二分图的概念二分图又称作二部图,是图论中的一种特殊模型。设G=(V, E)是一个无向图。如果顶点集V可分割为两个互不相交的子集X和Y,并且图中每条边连接的两个顶点一个在X中,另一个在Y中,则称图G为二分图。二分图的性质定理:当且仅当无向图G的每一个回路的次数均是偶数时,G才是一个二分图。如果无回路,相当于任一回路的次数为0,故也视为二分图。二分图的判定如果一个图是连通的,可以用如下的方法判定是否是二分图:在图中任选一顶点v,定义其距离标号为0,然后把它的邻接点的距离标号均设为1,接着把转载 2020-07-02 20:22:11 · 156 阅读 · 0 评论