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qdmoxf
这个作者很懒,什么都没留下…
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试图理解 Decagon(四)结果
结果原创 2020-02-02 10:20:07 · 362 阅读 · 0 评论 -
试图理解 Decagon(三)环境设置
5 Experimental Setup说明选择80%的药物对 作为训练集,剩下两个10%分别作为验证集和测试集选择80%的副作用(边)来训练模型,10%的drug 对来选择模型参数。同时,会以 additional 向量 xxx 的形式 把其他所需的信息(比如药物自身的side effect)集成到模型中去为了避免产生环同时没有信息泄露,我们保证:我们所给出的多药物副作用仅仅出现在...原创 2020-02-02 10:19:48 · 582 阅读 · 0 评论 -
试图理解 Decagon(二)具体方法
4 图卷积 Deacgon 方法综述关系被表示为一个图 G = (V,R),其中,节点N(蛋白质、药物)vi∈V,和标记的边(vi,r,vj),r代表边的类型,分别由蛋白质间的作用某种药物 与其作用蛋白质间的关系存在于某两种药物间的副作用关系除此之外,我们允许以节点向量的方式引入其他可用信息。不同的节点可以拥有不同的节点特征。对任务进行描述:考虑识别药物对之间的联系和可能存在的...原创 2020-02-02 10:19:33 · 1393 阅读 · 0 评论 -
试图理解 Decagon(一)背景与综述
论文部分1 Present study重要观察结果一起服用的两种药物,他们针对的蛋白质会比随机组合的药物针对的蛋白质有更多的重叠。(这一点告诉我们 药物-蛋白质 的关系包含着我们建模需要的很重要的信息)为了能够更好地为药物副作用建模,考虑一个蛋白质-蛋白质的映射关系是很重要的...原创 2020-02-02 10:19:01 · 981 阅读 · 0 评论