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原创 学习资源资料汇总——R语言
sthdaR语言+统计+plot 速查网站No.1The R Graph GalleryR语言制作的优秀图标的收集网站- Data VisualizationTwitter上邂逅的一个课程,open free, 老外的tutorial 做的就是好,待我学完再来反馈
2021-05-11 21:52:09 230 3
原创 Pipeline-MRI-less pet analysis
MRI-less PET analysis pipeline(Aβ: AV45/FBB Tau: AV1451)这些petimage不包含空间信息,需要freesurfer来定义脑区,而FDG-pet则不需要PET analysis:set origincoregister to MRI image (统一配准到baseline MRI image)spatial normalization to MNI spaceFreesurfer parcellation: d...
2020-12-08 17:57:02 421
原创 ADNI数据_PET——官方预处理
The Above is the PET description of three ANDI datset.:原始image是six 5min frames 30-60 min post injection,是指整个imge包含6个frames?每个frame成像时间是5mins吗?官方提供了four types of processed PET image data in the database.(也是我们直接用于提取和分析的图像)一个subject一共6个frames,后5个co-regi.
2020-12-08 10:47:11 2838 2
原创 SZBL实习_linux环境配置——20201207
Background:需要在linux上跑matlab,freesurfer,python3依赖的pet-analysis pipeline,踩坑记录尝试docker失败,转vmware虚拟机(版本过高一直报错,低版本成功),linux上python3的更新,linux和python基本语法的使用docker环境布置linux,matlab和freesurfer……不会,待续VMware+ubuntu安装配置VMware-workstation-full-15.5.1-15018445.exe
2020-12-07 17:12:21 171
原创 datawhale_Day4_task09_线性代数
矩阵和向量积numpy.dot(a, b[, out])计算两个矩阵的乘积,如果是一维数组则是它们的内积。矩阵特征值与特征向量numpy.linalg.eig(a) 计算方阵的特征值和特征向量。numpy.linalg.eigvals(a) 计算方阵的特征值。奇异值分解u, s, v = numpy.linalg.svd(a, full_matrices=True, compute_uv=True, hermitian=False)奇异值分解QR分解q,r = numpy.linalg.qr
2020-11-29 23:45:43 106
原创 datawhale_Day3_task08_统计相关_补卡
数据次序的统计计算最小值numpy.amin(a[, axis=None, out=None, keepdims=np._NoValue, initial=np._NoValue, where=np._NoValue])Return the minimum of an array or minimum along an axis.计算最大值numpy.amax(a[, axis=None, out=None, keepdims=np._NoValue, initial=np._NoValue, wh
2020-11-28 22:49:13 88
原创 datawhale_Day2_task02_随机抽样
这两天太忙,待重新学习随机抽样二项分布import numpy as npimport matplotlib.pyplot as pltfrom scipy import statsnp.random.seed(20200605)n = 9# 做某件事情的次数p = 0.1# 做某件事情成功的概率size = 50000x = np.random.binomial(n, p, size)'''或者使用binom.rvs#使用binom.rvs(n, p, size=1)函数模拟一个
2020-11-25 23:16:03 80
原创 datawhale_Day2_task01_数据类型及数组创建
常量numpy.nannumpy.infnumpy.infnumpy.pinumpy.e列表/数组的创建数组是一种特殊变量,能够一次包含多个值,数组可以在单个名称下保存多个值,您可以通过引用索引号来访问这些值。(1)创建列表中括号! number = [1,2,3,4,‘罗思洋’]:列表中可以包含整形、字符串、浮点型数据,还可以包含另一个列表。(2)列表中添加元素(3)从列表中获取元素(4)列表反转(5)列表拼接与重复(6)元素是否存在于列表中的判断(7)其余操作
2020-11-24 21:04:37 107
原创 datawhale_Day1_task06_输入输出
numpy二进制文件save() :savez() :输入压缩文件.npz格式,也可将多个数组保存到一个文件load()oimport numpy as npoutfile = r'.\test.npy' #r表示非转义np.random.seed(20200619)x = np.random.uniform(0, 1, [3, 5])np.save(outfile, x)np.set_printoptions(precision=3)y = np.load(outfile)pri
2020-11-23 22:26:01 106
转载 Linux里的2>&1究竟是什么
Linux里的2>&1究竟是什么 </h2> <div class="postbody"> 转载自 GGxiaobai 我们在Linux下经常会碰到nohup command>/dev/null 2>&1 &这样形式的命令。首先我们把...
2019-11-14 14:29:03 191
转载 linux怎么执行sh文件
本文介绍Linux下面用命令怎么执行.sh文件的方法,有两种方法:一、直接./加上文件名.sh,如运行hello.sh为./hello.sh【hello.sh必须有x权限】二、直接sh 加上文件名.sh,如运行hello.sh为sh hello.sh【hello.sh可以没有x权限】方法一:当前目录执行.sh文件【步骤一】cd到.sh文件所在目录比如以hello.sh文件为例,如下图【步骤二】给....
2019-11-14 11:40:23 2729
转载 linux--Linux 各目录及每个目录的详细介绍
<div id="article_content" class="article_content clearfix" style="height: 2274px; overflow: hidden;"> <div class="article-copyright"> ...
2019-11-14 10:48:10 123
转载 医学图像处理:Ubuntu16.04安装freesurfer教程
版权声明:本文为博主原创文章,遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议,转载请附上原文出处链接和本声明。 ...
2019-11-05 09:42:11 965 2
空空如也
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