影像学中常用的Human Brain Atlases

最新推荐文章于 2024-11-13 10:53:47 发布
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分类专栏： Neuroimage
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本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_41217051/article/details/116465319
版权
本文探讨了在MRI和PET研究中广泛应用的DKT-40surfaceatlas，它是神经影像分析中常见的表面解剖模板，对于理解大脑结构至关重要。Asegsubcorticalatlas则补充了对深层结构的解析。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

DKT-40 surface atlas

This is the most common surface atlases,either in fmri and PET study.
在这里插入图片描述

Aseg subcortical atlas

在这里插入图片描述

网络分辨率对人类新皮层拓扑特性的影响
从事脑科学核磁共振方法学研究，在Nature communications等权威期刊发表研究论文，熟练掌握磁共振处理方法和统计学方法，欢迎大家和我交流。
01-06 1108
来源于文章 Effects of network resolution on topological properties of human neocortex 创新点 解剖皮质网络的拓扑组织随稀疏性和皮质尺度的分辨率而变化，提供了一种新颖的方法——基于Ledoit–Wolf 引理的最新技术来缩小协方差估计值，收缩过程对区域之间的协方差进行校正，目的是减少从回归分析得出的均方误差。 摘要 图论分析应用于神经影像数据集，为人类新皮质的大规模解剖组织提供了宝贵的见解。这些研究大多数以不同的皮层规模进行，从而导致
艾伦脑图谱（Allen Brain Atlas）
shinuone的博客
06-17 3700
艾伦脑图谱（Allen Brain Map）：由艾伦脑科学研究所（Allen Institute for Brain Science）开发的大脑图谱，目前已生成多个 艾伦大脑参考地图集（Allen Brain Reference Atlases）。
Human Brain Mapping: 自发性大脑活动的有向功能连接
悦影科技
01-31 2464
在过去的几十年中，大量的fMRI研究已经表明自发性大脑活动以特定脑区信号之间的同步化增强为特点，而这些在静息状态下表现出活动信号同步化增强的脑区称之为静息态网络（resting-state networks，RSN）。其中一个研究最多的RSN是默认网络（default-mode network，DMN），其在静息状态下的激活程度最高。DMN主要包括后扣带回（posterior cingulate ...
Freesurfer皮质分割采用的数据集Cortical Parcellation
KaSuo幻影的博客
01-09 1万+
Cortical Parcellation 官网原文链接：http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/CorticalParcellation Desikan-Killiany atlas ?h.aparc.annot Destrieux atlas ?h.aparc.a2009s.annot Freesurfer中mris_ca_trainandmris_ca_label程序可以通过一个手动标记的训练集估计概率信息来...
freeSurfer颅骨剥离
fanre的专栏
05-23 6966
命令参考 https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/recon-all recon-all -i 输入文件路径.nii -s 创建用于保存文件夹名称 -sd 保存文件夹所在的目录 -命令 -autorecon2-cp 输入输出参考 https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/ReconAllDevTab...
Freesurfer recon-all命令详解及使用示例
handsofgod的博客
06-28 1万+
本文详细说明了freesurfer软件工具中recon-all命令的具体步骤，并解释了每一步的作用，方便在对MRI图像进行预处理时对每一步有详细的理解。同时也可以根据各个步骤自定义处理流程。
FreeSurfer入门(1) Output Data
weixin_38878828的博客
07-25 2784
因一些原因需要学习FreeSurfer,然而教程比较少有些难懂,看了一段时间觉得可能要钻钻牛角尖才可以完成学习,所以开始记笔记(基本上是逐字逐句的读tutorial),如果有错误欢迎指正
【3D Slicer】的小白入门使用指南四
图挖掘领域，新晋砖家 ☞ 未来可期，欢迎和静静一起学习交流吖
11-13 969
● 开放解剖（OA）浏览器是由神经影像分析中心开发的，基于网络浏览器技术构建的图谱查看器。● OA浏览器将解剖模型和分割图像与语义信息结合起来。本教程提供了对OA浏览器技术的介绍。本教程中的示例基于SPL/NAC大脑图谱。教程大纲第一部分：访问OA浏览器图谱第二部分：查看和与3D模型及分割图像交互第三部分：导航解剖层次结构。
DiFuMo脑成像功能模式词典：多维度提取与优化
IDP是研究个体间大脑功能差异的指标，常用于神经影像学研究中。 ### 功能信号的维度 DiFuMo支持不同的功能信号维度，包括64、128、256、512和1024。这些不同维度的设置使得研究者能够根据实验需求选择最合适的信号...
python下医学图像处理库的安装问题(更新中)
jessican_uestc的博客
03-14 7251
1. pip install dipy：DIPY is a python toolbox for analysis of MR diffusion imaging.2. pip install nibabel：安装用于读写影像数据文件的程序包3. pip install --trusted-host pypi.python.org SimpleITK：安装ITK包=================...
（二十八：2021.01.10）MICCAI 2019 追踪之论文纲要（中）
Jojo论文基地
01-09 3439
讲在前面 暂时先更新PART I, 持续更新。 论文目录 PART I Optical Imaging（光学影像） 概要 1.Enhancing OCT Signal by Fusion of GANs: Improving Statistical Power of Glaucoma Clinical Trials通过GAN融合增强OCT信号：提高青光眼临床试验的统计能力 2.A Deep Reinforcement Learning Framework for Frame-by-Fr
ROI Volume<=>Surface空间变换提取数据
lazysnake666的博客
07-20 1231
1使用volume-defined ROI提取surface数据(比如, Cortialthickness)来源：Freesurfer官方教程https://surfer.nmr.mgh...
freesurfer提取皮层数据
drwyan的博客
09-23 1583
【代码】freesurfer提取皮层厚度。
Freesurfer学习笔记——Anatomical ROI analysis 7/13
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KaSuo幻影的博客
05-18 1万+
1. Preparations 本教程简要介绍解剖ROI分析，包括了解FreeSurfer标签文件，从标签文件中提取ROI度量以及创建个人和组统计文件以进行进一步分析。 <source_freesurfer> export TUTORIAL_DATA=<path_to_your_tutorial_data> export SUBJECTS_DIR=$TUTORIAL_DATA/buckner_data/tutorial_subjs/group_analysis_tutorial
fsbrain的学习笔记
clancy_wu的博客
11-01 1554
之前分析皮层数据，基于freesurferformats构建了一套自己的脚本，后来偶然间发现了fsbrain，把这些都封装好了，并且还包括可视化。因此，就抽空来学习学习。
fMRI brain atlas from Standford Find Lab 常用大脑图谱/模版（fMRI，斯坦福Find实验室）...
weixin_33736832的博客
01-10 2146
Source: Standford Find Lab NOTE that all the atlas could be downloaded at the source page. Whole brain map: 90 fROIs and 499 fROIs Reference: 90 fROIs: Shirer WR, Ryali S, Rykhlevskaia E, Menon V, G...
医学图像中的atlas代表什么
qq_38932073的博客
04-24 5498
“Atlas”一词通常指带有标签的地图，可以用来作为导航工具，以找到相对于其他店在一个地理区域内的位置。这些altas可以非常精确，提供地图上的点与实际位置之间的一一对应关系。因此，一个atlas可以概括为与一组结构相关的特定结构的一组描述符。在医学上，人体解剖学atlas是一个完全标记的人体图 ，可以通过它来找到特定的解剖区域或亚解剖区域。 上图代表的就是医学图像分析中的Atlas。 最上面一排从左到右代表的分别是：腹部3D CT扫描中手工标记的肾脏和肝脏，从单一图像中表示的肾脏和肝脏，以图的方式表达的
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