【ITK类学习】使用itk读取DICOM数据序列

ITK读取DICOM数据

1、itkImageSeriesReader

ITK 库中用于读取图像序列的类，该类支持从多个 n-1 维图像文件构建 n 维图像，常用于读取一系列的2D图像文件，并将其组合成一个三维图像。

该类支持读取多种格式的图像文件，例如 DICOM、TIFF、NIFTI 等，读取的文件之间的格式可能有所不同，但图像数据的size必须相同。

使用该类需要指定图像序列的格式以及文件路径，然后调用 Update() 方法进行读取。读取后，可以通过 GetOutput() 方法获取读取的图像数据。此外，还可以通过 SetMetaDataDictionaryArrayUpdate 设置读取元数据，并通过 GetMetaDataDictionaryArray() 方法获取元数据。

2、itkGDCMImageIO

ITK 中的一个图像读写模块，用于读取和写入 DICOM V3.0 和 ACR/NEMA 1&2 未压缩图像的 ImageIO 类，包括单幅和多幅图像。

该类使用 GDCM 库实现，GDCM 是一个开源的 DICOM（数字图像和通信医学）库，用于读取和处理医学图像数据，下载网址：https://sourceforge.net/projects/gdcm。

使用 itkGDCMImageIO 可以方便地读取和处理 DICOM 格式的医学图像数据，并且能够保存为 DICOM 格式的图像数据。它提供了丰富的功能，包括对图像元数据的读取和修改、对像素数据的访问，以及处理多帧 DICOM 图像等。

使用 itkGDCMImageIO首先需要安装 GDCM 库并配置 ITK。然后，在编写代码时，可以通过包含 “itkGDCMImageIO.h” 头文件来使用 itkGDCMImageIO 类，使用它的成员函数来读取和写入 DICOM 格式的图像数据。

3、itkGDCMSeriesFileNames

该类用于获取DICOM系列文件的文件名。

该类可以获取给定DICOM系列的文件名，并进一步加载和处理这些文件。通过提供DICOM文件夹的路径作为构造函数的参数，可以创建itkGDCMSeriesFileNames对象，并使用GetFileNames方法获取文件名的列表。可以根据需要进一步筛选文件名列表，并使用SetSeriesID方法设置DICOM系列的ID。

此外，还可以使用GetSeriesUID方法获取DICOM系列的唯一标识符。

其中：GetInputFileNames() 函数用于获取输入文件的名称，GetFileNames() 函数用于获取整个系列的文件名称。

例如，如果你有一个包含多个 DICOM 文件的文件夹，GetInputFileNames() 函数将返回该文件夹中的所有文件的名称。而 GetFileNames() 函数将返回整个 DICOM 系列的所有文件的名称，包括子目录中的文件。

总的来说，GetInputFileNames() 函数用于获取单个文件的名称，而 GetFileNames() 函数用于获取整个 DICOM 系列的所有文件的名称。

代码示例：

#include <iostream>
#include <experimental/filesystem>

#include <itkImageFileReader.h>
#include <itkImageSeriesReader.h>
#include <itkGDCMImageIO.h>
#include <itkGDCMSeriesFileNames.h>

bool LoadDicomSerise(std::string seriesDicomDir)
{
   
    //校验路径是否存在或是否为空
	if (std::experimental::filesystem::exists(seriesDicomDir)==false ||
	    std::experimental::filesystem::is_empty