【无标题】linux 下安装 rpy2

rpy2 安装

可以使用conda或者pip安装，不过我用conda一直没有安装成功，pip安装如果不成功的话，建议指定ryp2的版本号，可能某个版本就安装成功了。

pip install rpy2==3.4.5

安装R

建议直接在linux上安装R，不要用conda下的R，因为不好指定R的lib，再后续使用中可能会报错
在安装过程中，编译R时，一定要添加一个参数–enable-R-shlib

./configure --enable-R-shlib

然后再进行

make && make install

配置环境变量

找到你安装R的位置，将lib添加到环境变量中，可以每次使用前临时添加，也可以添加到~/.bashrc中。

export LD_LIBRARY_PATH=${LD_LIBRARY_PATH}:/usr/local/lib64/R/lib/

如果出现以下报错信息的话

cannot find system Renviron
Fatal error: unable to open the base package

要配置R_HOME的环境变量

R_HOME=/usr/local/lib64/R

这两个环境变量配置好后，就能运行成功了！