java调用r脚本_JAVA调用R脚本

0 前言

R是一种非常方便易用的绘图、统计分析、ML算法设计方面的脚本语言。实际中有这样一种场景：算法工程师用R搭建了机器学习算法模型，想用于javaweb之中但是又不想重新用java写一遍算法模型，那么可以考虑java程序中直接调用R的脚本。JAVA负责系统的构建，R用来做运算引擎，从而实现应用型和分析性相结合的系统。

本文将搞清楚如下几个问题：

1)java调用R的方式有哪些及每种方式如何使用？

2)这些调用方式的有哪些优缺点？

下面开始。

1 java调用R的两种方式

1.1 远程调用模式(使用Rserve)

Rserve是一个基于TCP/IP的服务器，通过二进制协议传输数据，可以提供远程连接，使得客户端语言能够调用R。

Rserve作为一个package发布在CRAN上，在服务端计算机安装R之后可以直接使用install.packages(“Rserve”)进行安装。需要使用时在R控制台下加载该包，然后输入命令Rserve()，开启服务器就可以供客户端调用。

首先建立一个新的连接，然后就可以使用eval之类的方法将R中的表达式传到服务器端，通过R求值后传回JAVA中REXP类型的变量，然后打印出来，整个过程非常简单。由于不需要对R进行初始化，因此速度会比较快。在linux等其他系统下可以同时建立多个连接，但是在Windows下只允许同时打开一个连接，后续的连接都会共有相同的命名空间。

1.1.1 Rserve的安装、启动、关闭方法

方法一：

准备工作：必须先安装并配置了R语言，可去官网https://www.r-project.org下载安装。

在命令行窗口依次执行如下命令：

每次启动r虚拟机时：r

第一次安装Rserve包时： install.packages(“Rserve”)

第一次加载Rserve包时：library(Rserve)

每次需要启动Rserve服务：Rserve()

关闭Rconnection连接：

关闭Rconnection连接用rc.close();

方法二：

使用Rstudio软件直接安装Rserve的包。

操作略。

1.1.2 自定义Rserve的配置文件

1)查看Rserve的help选项，Rserve包被安装在R的安装目录的library文件夹下，命令如下图所示。

2)查看Rserve的配置项

配置项含义：

config file: Rserv.cfg 配置文件名称

working root: R运行时工作目录 /tmp/Rserv

port: 6311 通信端口

local socket: TCP/IP TCP/IP协议

authorization: 认证未开启

plain text password: 不允许明文密码

passwords file: 密码文件，未指定

allow I/O: 允许IO操作

allow remote access: 远程访问未开启

control commands: 命令控制未开启

interactive: 允许通信

max.input buffer size: 文件上传限制262mb

3)新建自定义Rserve配置文件Rserv.cfg(可先创建Rserv.txt添加内容后改后缀为cfg)，该配置文件会覆盖Rserve的默认配置，文件位置如下图。

打开Rserv.cfg，其内容设置如下：

workdir /tmp/Rserv

remote enable

fileio enable

interactive yes

port 6311

maxinbuf 262144

encoding utf8

control enable

source start.R

plaintext enable

该自定义配置项包含了一个Rserve启动脚本start.R,该脚本可用于启动Rserve时输出提示信息，新建该脚本文件并输入内容：

cat("This is my Rserve!")

print(paste("Rserve Server start at ",Sys.time()))

注：Rserve的服务器默认端口号是6311，当然用户也可以指定其他端口号。

1.1.3 Rserve的使用方法

1) java项目调用Rserve需要三个jar文件：REngine.jar RserveEngine.jar Rserve.jar

常用类及方法如下：

Rconnection()：连接R服务

eval():执行R语句，返回REXP类型数据

assgin()：声明变量

REXP类：其提供了asInteger(), asIntegers(), asString(), asDouble(), asDoubles(), asList()等方法将REXP类型数据转换成java相应类型的数据

2) 测试代码1,打印R版本信息：

package com.rTest;

import org.rosuda.REngine.REXP;

import org.rosuda.REngine.Rserve.RConnection;

public class Test {

public static void main(String[] args) {

RConnection rc = null

try {

rc = new RConnection();//建立与Rserve的连接

REXP x = c.eval("R.version.string");//执行R语句

System.out.println(x.asString());

} catch (Exception e) {

e.printStackTrace();

} finally{

rc.close();//关闭与Rserve的连接

}

}

}

3) 测试代码2，调用R文件中自定义函数：

创建R文件test.R

myFunc

x

}

java调用代码如下：

package com.rTest;

import org.rosuda.REngine.REXP;

import org.rosuda.REngine.Rserve.RConnection;

RConnection rc = new RConnection();

// test.R的路径

String fileName = "D:\\test.R";

rc.assign("fileName", fileName);

//执行test.R脚本，执行这一步才能调用里面的自定义函数myFunc，如果不行，就在R工具上也执行一下test.R脚本

rc.eval("source(fileName)");

String num = "3";

//调用myFunc函数

REXP rexp=rc.eval("myFunc("+num+")");

//返回类型是一个整数类型，所以用asInteger

System.out.println(rexp.asInteger());

rc.close();//用完记得关闭连接

1.2 内嵌模式(使用JRI)

JRI，全名是Java/R Interface，是通过调用R的动态链接库从而利用R中的函数等。通过install.packages(“rJava”)安装rJava就行，在安装文件夹中，可以看到一个jri的子文件夹，里面有自带的例子可以用来测试。

1)配置环境变量：在PATH中添加%R_HOME%/bin和%R_HOME%/library/rJava/jri，注意R_HOME的路径要正确。

2)安装rJava： install.packages(“rJava”)

3)设置环境变量：PATH后添加%R_HOME%\library\rJava\jri

4)获取jar包：把安装目录jri文件夹下的JRI.jar、REngine.jar和JRIEngine.jar放进Java工程添加到工程中。

此模式只需要了解三个jar提供的API用法即可，不再详述。

2 两种方式优缺点

1)Rserve

优点是javaWeb项目不需要去维护R的运行，通过TCP/IP协议直接进行通讯。

缺点是它对中文的支持很弱，尤其是在windows的环境中，基本不支持中文；在linux环境下，对中文的支持稍微好些。不是完全支持中文的话，不能用于返回值有中文或者输入有中文的系统。

2)JRI

优点是对中文的支持较好。

缺点是使用JRI模式下很容易造成整个系统的崩溃，比如在java调用R的时候，中间出现了异常或者错误，导致java虚拟机崩溃，从而导致整个系统崩溃。

3 总结

实际应用中推荐是Rserve，web系统与R的维护相对独立，增强了系统的灵活性和健壮性。

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作者：StevenSun2014

来源：CSDN

原文：https://blog.csdn.net/tyhj_sf/article/details/81320731

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