顺式作用元件包括_充电课-顺式作用元件分析(基础知识及预测)

本文介绍了顺式作用元件的基本概念,包括增强子、终止子、沉默子、绝缘子和专一性元件,强调它们在基因表达调控中的作用。此外,还详细讲解了如何利用Plant CARE数据库进行顺式作用元件预测,并提到了《基因家族分析》课程,涵盖了从生信技能到基因家族分析的多个方面。

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概念:

顺式作用元件(cis-acting element)是存在于基因旁侧序列中,能影响基因表达的一段DNA序列,它们的作用是参与基因表达的调控;顺式作用元件本身不编码任何蛋白质,仅仅提供一个作用位点,要与反式作用因子(多是转录组因子)相互作用而起作用。

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顺式作用元件在分子遗传学领域,相对同一染色体或DNA分子而言为“顺式”(cis);对不同染色体或DNA分子而言为“反式”(trans)。

分类:

按功能特性分为:通用调节元件如启动子、增强子及沉默子、绝缘子和专一性元件:如激素反应元件,cAMP反应元件等。

1. 增强子

位于结构基因附近,能够增强该基因转录活性的一段DNA顺序称为增强子(enhancer)。

2. 终止子

位于基因编码区下游,能够终止RNA转录合成的特殊DNA序列称为终止子(terminator)。

3. 沉默子

位于结构基因附近,能抑制该基因转录表达,称为沉默子(silencer);沉默子是一种负性调控元件,其作用特征与增强子类似,在组织细胞特异性或发育阶段特异性的基因转录调控

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