在Linux中提交文件是:.car文件、.input文件、.mdf文件。文件是通过Material Studio计算面板中Save files产生。提交计算方式是:“路径/RunDMol3.sh -np 2 seedname”。但一直提示“There is no Coordinates File”,在另一个帖子看的是“.car”文件需要改名字,但没有说怎么改。
我的.car文件如下:
!BIOSYM archive 3
PBC=ON
Materials Studio Generated CAR File
!DATE Sun Jan 21 20:09:26 2018
PBC 7.6136 7.6136 14.1443 90.0000 90.0000 120.0000 (P1)
Cu1 0.002116813 0.005298122 4.229957917 XXXX 1 xx Cu 0.000
Cu2 1.268941437 0.732633625 2.072164194 XXXX 1 xx Cu 0.000
Cu3 -0.002094667 1.459967040 -0.085624583 XXXX 1 xx Cu 0.000
Cu4 2.539982227 0.005297205 4.229956826 XXXX 1 xx Cu 0.000
Cu5 3.806804350 0.732632679 2.072169288 XXXX 1 xx Cu 0.000
Cu6 2.535771083 1.459967115 -0.085621542 XXXX 1