语言绘制基因表达热图_手把手演示R语言绘制多个基因表达值小提琴图

1. 数据准备

# 设定工作目录
data "data.csv",header = T,sep = ",")
colnames(data) "gene",colnames(data)[-1])
test 1:5,1:5] 
View(test) # 预览数据集

#
data 2:ncol(data)],by=list(data$gene),FUN = mean, na.rm=T)## 重复基因求平均值
genename rownames(data) data1]
sampleID data1, as.numeric)
rownames(data) ##分组信息构造
group "N",14),rep("DCIS",9),rep("IBC",9),rep("NS",14),rep("DCISS",11),rep("IBCS",9))
length(group) == dim(data)[[1]] ##确认信息匹配

## [1] TRUE
data data$group table(data$group)
## 
##  DCIS DCISS   IBC  IBCS     N    NS 
##     9    11     9     9    14    14
data[1:5,1:5]  ##行为sample名 列为gene
##      ACVR1B    CX